供应链环境下的库存问题不同于传统企业的库存问题。这些差异反映了供应链管理对库存的影响。传统的企业库存管理注重单个库存成本的优化，从库存成本和订单成本两方面确定经济订货数量和订货点。从单一库存的角度来看，这种库存管理方法具有一定的适用性，但从整个供应链的角度来看，单一的企业库存管理方法显然是不够的。
目前供应链管理环境下的库存控制存在以下主要问题：
1、没有供应链的整体概念
虽然供应链的整体绩效取决于供应链中每个节点的绩效，但每个部门都是独立的单位，都有自己的目标和使命。有些目标与供应链的总体目标无关，更有可能发生冲突。
供应链库存决策不考虑整体效率是一个普遍的问题，一般供应链系统没有针对整个供应链的绩效评价指标。有些企业将库存周转率作为供应链库存管理的绩效评价指标，但没有考虑对用户的响应时间和服务水平。顾客满意度应成为供应链库存管理的重要指标。
2、对用户服务的理解与定义不恰当
供应链管理的绩效应由用户来评价，或由对用户作出反应的能力来评价。然而，对用户服务的理解和定义不同，这就直接导致了用户服务水平的差异。
3、交货数据状态的不准确
当客户下订单时，他们总是想知道什么时候可以交货。在等待交付的过程中，订单的交付状态也可能被修改，特别是在交付延迟的情况下，我们不否认一次性发货的重要性，但我们必须看到，很多企业没有及时准确地向用户提供订单延迟发货的修改数据，结果当然是用户的不满。
4、信息传输系统效率低下
在供应链中，供应链节点企业之间的需求预测、库存状况、生产计划等是供应链管理的重要数据。这些数据分布在不同的供应链组织中。为了有效、快速地响应用户的需求，它们必须实时传输。因此，有必要这样改变供应链的信息系统模型，使供应链中的库存数据能够实时、快速地传递。但目前，许多企业信息系统还没有很好的集成。当供应商需要了解用户的需求时，往往会得到延迟的信息和不准确的信息。
5、忽视不确定性对库存的影响
供应链运作中存在许多不确定因素，如订单提前期、货物运输状况、原材料质量、生产过程时间、运输时间、需求变化等。为了减少不确定性对供应链的影响，首先要了解不确定性的来源和影响程度。
许多公司没有认真研究和跟踪不确定性的来源和影响。他们错误的估计了物料在供应链中的流动时间，导致一些项目的库存增加，一些项目的库存短缺。
