南明唐王政权在福建成立之时，郑芝龙、郑成功父子都是其拥护者。郑成功对唐王的复国志非常敬佩，唐王对郑成功也十分赏识，赐其姓名朱成功（“国姓爷”的由来），而且封他为忠孝伯，赐尚方宝剑，甚至对郑成功说：
“恨朕无女妻卿。”
唐王的笼络也收到效果，郑成功日后为感谢唐王知遇之恩，一生抗击清朝，原因也与此相关。
郑成功
郑芝龙不听郑成功劝告，投降了清朝。唐王不久也殉国，而郑成功的母亲也被清军戕害。面对国仇家恨，郑成功哭文庙、焚儒衣，弃文从武，举起抗清旗帜。他起兵之初，势力羸弱，但各地勤王之师纷纷来归，经过几年的努力，实力强劲。到顺治亲政时，郑成功已经有厦门作为根据地，并在海澄、漳州等地数次打败清军。
顺治九年，“湖南、川、广处处用兵，力不暇及”，朝廷担心各地反清复明势力与郑成功“万一勾连狂逞，为祸愈大”，因此，满清大臣向顺治建议，对郑成功实行招抚。郑成功的父亲已经归顺清朝，如果打出“亲情牌”，预料郑成功大概率会投降。顺治采纳招抚的建议，下旨给闽浙总督刘清泰，命其策划。在圣旨中，顺治先向郑成功解释多尔衮对其父背信弃义，以及清军进攻厦门是地方军官的“行事乖张”。郑成功只要归顺，朝廷就会给高官厚禄，不需要来京城，可以在东南沿海管理对外贸易与船只。由于有这道圣旨，朝廷与郑成功的谈判开始了。
顺治
与此同时，郑芝龙也在朝廷的授意下，派家人带着亲笔信到福建与郑成功见面，希望以父子亲情劝说郑成功投降。郑成功在回复郑芝龙的信中写道，清廷没有兑现优待父亲的承诺，而且对福建巡抚攻打厦门表示不满，同时也说了“兵集难散”的善后问题。郑成功虽然没有拒绝投降，但提出的条件也不少。
顺治知道后又下旨，除了答应封郑成功为海澄公、郑芝龙为同安侯、郑鸿逵为奉化伯、郑芝豹为左都督外，又保证说：
“敕谕到日，满洲大军即行撤回，闽海地方保障事宜，悉以委托。”
为了以示诚意，顺治特派专差与郑成功的表亲携带公爵印信南下。
郑芝龙
朝廷担心郑成功拒绝接受海澄公印信，又指定郑芝龙家人南下厦门劝降。郑成功为了父亲在京城的安全，又想到不如“将计就计，权措粮饷以裕兵食”，他写了一封信给郑芝龙。信中，郑成功依旧抱怨清廷不信守承诺，但也说到如果谈判成功，清廷就没有南顾之忧，也免掉“劳师远图，空费帑金”之难。同时，他也顺便待价而沽，提醒清朝，他已经是南明的王爵，“人臣之位已极，岂复有加之呼？”而古代也有“大义灭亲，从治命不从乱命”的案例，必要时可以移孝作忠。
郑成功的条件越来越大，但清廷经过王公大臣会议，还是以皇帝的名义又给了郑成功更加优厚的条件，不仅一门三爵位，并答应漳州、泉州、潮州、惠州四府之地让给郑成功，又发放钱粮。清廷为何会让步呢？
郑成功
在那段时间，湖南战场失利，亲王尼堪兵败被*，大西军又逼死孔有德，“两蹶名王，天下震动”，清军面临严重威胁。郑成功方面，也在东南沿海厉兵秣马，多次袭击清军。朝廷无法两线作战，对郑成功只能以合议牵制。
在后来的谈判过程中，郑成功看准了清廷的软肋，使劲要价，不仅要求扩大封地，而且要求仿朝鲜例。
清廷知道郑成功的心意后，改变了策略，实行剿抚并用，一边派郑芝龙的次子南下和谈，一边增派大军备战。谈到后来，双方又因剃发问题出现矛盾，结果和谈又是无疾而终。
郑芝龙
福建巡抚佟国器认为郑成功“终无剃发受抚之意”，上表顺治，主张讨伐，朝廷的王公也持同样看法。于是，顺治便任命济度为定远大将军入福建。郑成功也不甘示弱，积极扩军备战，攻打福建沿海。
由于郑成功以金厦为基地，海风强劲，满洲兵又不擅海战，因此，在交手时，清军水师溃不成军。清军在战败之际，深感以战“平海”难以实现，于是采取“禁海”之策，并离间郑成功的部下。
顺治因郑成功拒命不就抚，下令将郑芝龙一家就放至宁古塔，最后还以谋反罪将他们“咔嚓”。
郑芝龙和郑成功
父在清朝，子在南明。郑芝龙从投降的那一刻起，命运就已经掌握在清朝手中。在皇帝眼里，郑芝龙只是朝廷笼络郑成功的一颗棋子，有用时可以摆上棋盘，无用时可以扔到苦寒之地。
