宝可梦培育是通过生蛋孵化获得新的宝可梦的方式培养宝可梦，同时兼指对宝可梦能力，尤其是基础点数的培养。培养宝可梦的目的一般是为了获得在对战中最符合其能力的强大的宝可梦。
孵化宝可梦
生蛋
从第二世代开始，两只性别不同且具有相同蛋群的宝可梦被寄存在培育屋，或者被寄存的一方是百变怪的话，就有可能获得一个宝可梦的蛋。在第二世代中，不允许被判定为近亲的两只宝可梦生蛋。
玩家每走256步，会判定一次是否生了蛋。父母双方是同类且ID不同的话，判定通过的几率是69.3%；同类且ID相同或者不同类且ID不同的话，通过率是49.5%；不同类且ID相同的话，通过率是19.8%。从第五世代开始，如果已获得了圆形护符，则几率会分别提高至87.8%、79.5%和39.3%。如果被寄存的宝可梦没有共有的蛋群，或者是同性，则不可能生出蛋来。未发现组的宝可梦无论在什么情况下都不可能生出蛋来。
生出蛋以后，培育屋（寄放屋SMUSUM）外的工作人员的站位或身体朝向或姿势SMUSUM会与平时不同，此时在队伍上有空位的时候与他对话（若无空位，则会询问主角要将蛋放置身上或传送至电脑），就可以获得蛋。 宝可梦的能否生蛋遵循以下原则：
亲代子代
蛋群其一相同的宝可梦可以生蛋，子代为母方进化链的最低形态。
地鼠♂
（陆上群）
吼鲸王♀
（陆上群 和 水中2群）
吼吼鲸♂/♀
（陆上群 和 水中2群）
蛋群不相同的宝可梦不能生蛋。
超音蝠♂
