由于受低温的影响，冬季是大棚西红柿全年管理中难度最大的时期，此期管理水平的高低与全年经济效益关系最大，是夺取冬暖式大棚西红柿高产优质的关键时期。
一是抓好温度管理。大棚保温能力差，就会较早地出现低温障碍，表现为西红柿植株顶部幼叶生长缓慢，节间迟伸长缓慢，中下部叶片叶缘多数呈黄色，俗称“金边现象”。棚内热量损失的主要途径是白天放风，晴天棚内在不追施二氧化碳气肥的情况下，气温宜控制在 23℃ 左右；追施二氧化碳气肥，可把气温控制在 25-28℃。早晨拉苫子的时间以拉起苫子棚内温度不升也不降为宜，当气温达到 20℃时开口放风，随着气温升高，风口逐渐开大，下午当气温达到 15℃时，关闭风口并放苫子。阴天的情况下，白天气温控制在 10℃左右，防止植株徒长和降低呼吸消耗。
二是抓好光照管理。西红柿属喜强光照蔬菜，一般越冬栽培，通常不能满足其对光照强度的需要。若光照强度太小或光照时间太短，植株易徒长，抗病能力和抗寒能力下降。 要定期清扫棚膜，宜每半月对棚膜处理一次，并及时张挂反光幕。西红柿枝叶较浓密的大棚，要摘除部分遮果的小叶及植株下部的老化叶片，一般摘除叶片的部位与摘果的部位相一致。
三是抓好肥水管理。要视土壤墒情确定浇水，如果土壤较旱，可用暗沟浇 2-3 次小水，若不采用滴灌或暗沟浇灌的棚，不主张在低温期内浇水。空气相对湿度大是发生侵染性病害的一个必要条件。为了降低空气湿度，要全膜覆盖以降低地面蒸发，要交替运用喷粉、烟熏、喷雾等用药方法， 以减少因用药带来的空气湿度，有条件的采用滴灌，并在大行内铺入玉米秸。要抓好叶面施肥。此期地温较低，根系吸收能力较低，可进行叶面追肥，为了降低投资，还可用糖氮液 （1%尿素 0.3%磷酸二氢钾 1%糖） 0.25%硼砂作叶面肥，效果也不错。同时，搞好二氧化碳补充。提高大棚西红柿光合作用，可采用沼气、液化汽等燃料燃烧法、秸秆生物反应堆及有机肥分解法、碳酸氢铵与稀硫酸反应法等进行补充。
四是做好保花保果管理。低温期内，西红柿的花不能自行授粉，需人工辅助授粉，可用 20-30ppm 的防落素喷花保果，喷花时间应于每个花序开出 3-4 朵花时，选择晴天上午的 9:00-12:00 进行。当每穗果基部果实长到核桃大小时，从中选留 3-4 个个体基本一致，且果形端正，无病虫害侵害的果实作为留果。同时，要及时进行放蔓，延长了西红柿的采收期，以提高产量和经济效益。
五是抓好病害防治管理。大棚西红柿的侵染性病害主要病害有：早疫病、斑点病、晚疫病、灰霉病、叶霉病、软腐病、细菌性斑疹病等。防治西红柿侵染性病害，首先要搞好生态防治，即合理地调控棚内温度、湿度、光照等气侯因素，创造一个适宜西红柿生长而不利于病害发生的生态环境。其次要搞好化学药剂防治，每周用代森锰锌、百菌清等保护剂预防一次，如果一旦发病，必须 3-4 天用相应的化学药物防治一次。大棚西红柿生理性病害要进行行重点防治，以提高品质。可通过增强棚体保温能力，提高棚内温度水平和花芽分化质量预防畸形果；通过适时浇水避免土壤过于干旱，减少激素类膨果药物的使用等措施预防空心果；可用 1%过磷酸钙或1%氯化钙，每隔 10-15 天喷一次，开闭放风口时应缓慢进行以免西红柿植株迅速失水等措施预防脐腐病；通过随水冲施硫酸镁，每亩用量 20-25 公斤。叶面喷施 1%-2%的硫酸镁，每 10-15 天一次等措施预防镁缺素症；通过增强棚体保温能力，尤其是地温的提高，用 0.3-0.5%的硝酸钾叶面喷施，每 15 天一次等措施预防硝态氮缺素症；通过提高棚内温度水平，改善植株光照等措施预防筋腐果。
