滴灌系统施肥，一方面由于可溶肥随着水直接施入作物根系密积区，作物棵间空地上无任何肥料浪费。另一方面滴灌是以小流量滴水的形式渗入根区，非常容易控制。水、肥均不会有深层淋洗浪费。滴灌施氮，肥效可达74%，而传统施法不会超过30%。
采用滴灌系统施肥的缺陷是有可能堵塞滴头。肥料必须是可溶的，不可溶的肥会迅速堵塞滴头。肥料原料之间化学反应还会产生沉淀，时间一长，沉淀物会堵塞滴灌系统。
滴灌设施的要点
1化肥的溶解性和注意事项
利用滴灌系统施肥，要认真研究肥料的溶解性。不溶、溶解度低、或在某种条件下极易发生反应而形成沉淀的肥料均应该避免选用。
大部分固态化肥包衣，为了避免包衣对滴灌系统产生堵塞，最好选取少量样品放入溶解罐中搅拌，然后观察包衣的溶解情况。如果溶解后包衣物质沉淀到罐底，在施用时，让注肥器吸取上层溶液，不要搅动肥料溶液整体。
尿素，硝酸，硝酸钙，硝酸钾溶解时要吸收水中的热量，水的温度大幅降低。此时，溶解量可能达不到要求量。为了充分溶解，最好让溶液放几个小时，随着温度上升，其余未溶解部分会逐渐溶解，然后就可注入系统了。
注入之前，先做观测试验，以便评估堵塞滴头可能性。有些肥料要溶入肥料1~2小时，才能看出是否有沉淀形成，沉淀量多少。如果溶入水中数小时，溶液仍呈浑沌状，则有可能堵塞滴灌系统。如果数种肥料同时施，应在注入系统之前去取样，以实际比例同时放入观察罐中观察混合后的溶解情况，然后决定是否同时注入。
2滴灌系统施氮
氮肥是利用滴灌系统施用最多的肥料。氮肥一般水溶性好，非常容易随着灌溉水滴入土壤而施入到作物根区。但如果控制不当，也很容易产生淋洗损失。由于滴灌流量小（单滴头：4~8升/小时），控制淋洗损头非常容易做到。如果灌溉，施肥均实施自动控制，则淋洗损头可完全避免。
在所有氮肥中，尿素及硝酸铵最适合于滴灌施肥。因为施用这两种肥料的堵塞风险最小，氨水一般不推荐滴灌施肥，因为氨水会增加水的pH值。pH值的增加会导致钙、镁、磷在灌溉水中沉淀，堵塞滴头。硫酸铵及硝酸钙是水溶性的，但也有堵塞风险。
如果连续施氮，灌溉系统停泵后，灌溉系统中水中仍长期会有氮，这时，氮的存在会滋养微生物在系统中生长，最后堵塞滴头。
3滴灌系统施磷
磷在土壤中不像氮那样活跃。一般磷的挥发损失，淋洗损失没有氮多。大部分作物生长早期需要磷。所以应在栽种之前或栽种时施用磷肥。在生产阶段如发现缺磷迹象，在灌溉水中注入磷肥，还可补充磷的不足。
注入磷肥可能会堵塞滴灌系统。由于水与磷肥的反应，水中往往会产生固体沉淀，从而引起堵塞。过磷酸钙、农用磷酸一铵、农用磷酸二铵等固态磷肥由于溶解度低而不能注入灌溉系统中。而工业级的磷酸一铵，磷酸二铵、磷酸二氢钾、聚磷酸盐等磷肥是可溶解的，一般可以用于滴灌。
过磷酸钙注入灌溉水中常常可引起沉淀，有可能会引起堵塞。形成的沉淀物非常难溶解，当磷、钙离子在溶液中机遇时会形成二价或三价的磷酸钙，这种盐的溶解度很低。同样，磷和镁、锌会形成不溶于水的磷酸镁、磷酸锌，易堵塞滴灌系统。
有时要在滴灌系统中注入磷酸。除了是为作物施磷外，还可降低灌溉水的pH值，降低pH值可以避免沉淀物产生。降低pH值可以避免沉淀物产生。降低pH值的方法还有混合加入适当硫酸、磷酸，pH值可降低到小于4.0。但是如果长时间注入磷酸会导致作物缺锌。一般只有在水中钙和镁的组合浓度低于50ppm及碳酸氢盐浓度低于50ppm时才注入。
4滴灌系统施钾
钾肥都是可溶的，注入滴灌系统中，非常成功。可能出现的问题是当把钾肥在肥料罐中与其它肥料混合时，有可能产生沉淀物，沉淀物堵塞滴灌系统。滴灌施肥常用的钾肥有：氯化钾（KCI），硝酸钾（KNO3）。磷酸钾盐需要注意不要和钙镁锌等元素的肥料一起施用。
滴灌中常见8个错误
1、不合理的灌溉制度
滴灌流量低，使用者常常会看不到灌水过程。如果灌溉时间太长，则会产生深层渗漏浪费；如果灌溉时间太短，根系又将发生水分胁迫。要了解灌溉系统的灌水强度、植物需水量和土壤田间持水量，根据植物水分需要进行灌溉。灌溉周期和灌溉量要根据气候和植物的不同生长阶段而调整，不能始终采用同一灌溉制度。
2、采用错误的滴头
滴头通常分为2种型号，压力补偿式和非压力补偿式。压力补偿式虽然贵一些，但效果更好。首先，压力补偿滴头可确保每一个滴头出水均匀，施肥灌溉均一；其次，部分压力补偿式滴头可将堵塞滴头的杂物洗出，还有一些压力补偿式滴头流道很大，一般不会发生堵塞。
3、缺少过滤设备
许多使用者错误的认为井水不需要过滤，而事实上井水经常含有粗沙、细沙和一些化学物质，堵塞滴头。常见的过滤器有滤网、叠片和介质过滤器，如果水中有沙则宜采用离心过滤器。在开始安装过滤系统前，要对水质的物理和化学成分进行分析，根据水质情况采用合适的过滤设施和滴头。
4、没有通过滴灌系统进行施肥
水肥同步施入是滴灌的最大优点。植物根系生长具有向水、向肥性，肥料随灌溉水施用效率最高。但使用施肥灌溉系统要有防止肥料倒灌装置，以防肥料污染地下水和其他水源。
5、缺乏日常维护
滴灌系统需要通过精心维护以发挥最优性能。有条件的地方应经常冲洗滴灌管，保证设备水流畅通。根据实际需要，周期性配合使用有效的化学处理方法清洗管道。
6、没有压力表和流量表
这些简单的设备可以解决凭肉眼无法准确判断的滴灌系统问题。用压力表检测滴灌管首部、中部和滴灌毛管尾部的压力情况，对比设计压力或水压的历史情况，可以判断滴灌系统的问题。流量计可以快速判断水源的流量大小。
7、误认为所有的滴灌管品质一样
不同的滴灌管有不同的原材料品质、生产工艺和专利技术，更重要的是不同品牌管子的滴头结构设计是不同的。应该选择可以提供均匀水肥、具备抗阻塞性能、寿命长、易于安装和维护的滴灌管。
8、忽视长期运行费用
滴灌系统往往要使用一二十年以上，运送数百万立方米的水肥，所以考虑灌溉的均匀度、泵站的运行费用以及日常维护费用非常重要。一个前期设计良好的系统，可通过其良好的均匀度或节能性降低后期运行成本。另外，一些供应商有很多经验和专有技术，可以指导使用者选用正确的灌溉系统，并在运行和维护系统方面提供帮助。
