国五柴油机的燃油供给系统一般都是高压共轨，这种系统中的高压油泵和喷油器是非常精密和娇贵的，对柴油的清洁程度要求非常高，如果不慎使用了不清洁的柴油，或者没有及时更换燃油滤清器，或者使用了劣质的燃油滤清器，柴油中的细小颗粒物就会划伤甚至卡死喷油器柱塞，导致喷油器和高压油泵的损坏。比较明显的故障就是发动机不容易启动，或者启动后加速无力，还有的车型有冷车可以启动、热车无法启动的现象，一般也是喷油器故障导致的。
高压共轨系统中的高压油泵一般都是柱塞泵，它的作用是把低压柴油变成高压柴油并输送到共轨中，它的工作压力非常高，因此对柱塞偶件的精密度要求也非常高，一般只有几微米的配合间隙，如果柴油中有硬质颗粒，就会导致柱塞偶件划伤，严重时导致柴油泄漏，压力不足；而喷油器是燃油供给系统中最核心的零部件，它的精密度更高，柱塞偶件都是成对修磨的，配合间隙极小，如果柴油不清洁，很容易造成喷油器卡死故障。另外，如果柴油中含水量过高，一方面会导致高压油泵和喷油器润滑不良，另一方面也会腐蚀燃油系统，导致柱塞偶件出现气蚀等现象。
所以，国五柴油机对燃油系统的清洁度要求非常高，一般都设置了三道滤清系统，分别是粗滤器（油水分离器）、细滤器1和细滤器2。粗滤器可以过滤掉柴油中较大的颗粒物，同时兼有油水分离器的作用，可以将柴油中水分分离出来，避免水对燃油系统的侵蚀，在日常使用中要及时放掉这些水分，一般至少每个星期放一次水，也可以自己观察沉水杯中的水位，定期放水，粗滤器一般要求三万公里更换一次；细滤器1和细滤器2可以更精细的过滤柴油，可以去除柴油中全部的细小颗粒物，也称为柴油精滤器，一般要求一万公里左右更换一次。还有柴油箱也要定期清洗，清除油箱底部沉积的水、泥土等杂质，一半要求每五万公里清洗一次。
在实际使用中，我们要根据使用的环境和柴油的品质适当的缩短燃油滤清器的更换周期，比如经常在灰尘较大的矿山、工地等环境中使用，或者长期添加不明来路的柴油，都要提前更换燃油滤清器。以我们的经验，这个周期至少要缩短一半，如果汽车出现加速无力、加油不畅等故障，首先就要怀疑燃油滤清器是否堵塞。更换时一定要选择品质有保障的燃油滤清器，千万不能图便宜使用劣质滤芯，更换一套滤芯只是几百块钱的事，喷油器可是一个就上千元，高压油泵更是万元以上，孰多孰少自己衡量。另外，冬季柴油“挂蜡”了，柴油中就会出现一些细小的蜡质颗粒，也会对燃油系统造成较大的伤害，所以在冬季要及时调整柴油标号，避免“挂蜡”现象。
