这里的剧情其实就是TVB《西游记》中蜈蚣精变成假唐僧让蜘蛛精辨真假的那段剧情。当紫藤指出孙悟空为假孙悟空时二郎神降临，用捆仙索捆了孙悟空。可悲的是孙悟空大喊完捆仙索能捆住俺齐天大圣吗，却真的被捆住了，二郎神带着他去了诛仙塔要将他诛*。
另一边，孔雀王突然就悔悟起来，她表示此前以为如来有什么阴谋所以才让六耳猕猴混入取经队伍。如今她不想再看到太多伤亡，只想抢到锡杖毁了它。孔雀王给了狮驼王二心镜，让他帮六耳猕猴恢复身份。
再说那紫藤，因为帮忙分辨了真假美猴王，所以大家都很感激她，允许她一起上路。紫藤趁大家不注意偷走了九环锡杖，因为她从谛听处得知了一切，所以此时的她抢夺锡杖的目的只是要毁了它，免得被孔雀王得到后毁灭三界。当然，她此时并不知道孔雀王其实已经变好了。那六耳猕猴为了抢回锡杖就和紫藤打了起来，一不小心就*死了紫藤。
这时，六耳猕猴感应到唐僧有难，等他赶回后发现是狮驼王来抢夺锡杖。六耳猕猴和狮驼王大战，被狮驼王用二心镜恢复身份，六耳猕猴方知自己不是孙悟空。六耳猕猴被狮驼王所擒，为救六耳猕猴，唐僧甘愿将九环锡杖交给狮驼王。
狮驼王吸取九环锡杖的魔力，要毁灭灵山。二郎神赶到，远远不敌狮驼王。关键时刻六耳猕猴也赶到，联手二郎神依然不是狮驼王的对手。二郎神被狮驼王*死，临死之际大喊“孙悟空”，此时在诛仙塔被诛*的孙悟空得到感应，突然就变得强大起来，从诛仙塔逃出，直奔灵山。
孙悟空和六耳猕猴联手，最终打败狮驼王。九环锡杖发出神力，狮驼王和六耳猕猴灰飞烟灭。
影片结局中六耳猕猴转世为人，并找到了转世后的紫藤，只是紫藤已不认识他，并嫁为人妻，还有了孩子……
《真假美猴王之大圣无双》剧情并不复杂，对于原著也有着不少改编，企图打造成一部神魔相争的魔幻片。
