▲克罗地亚民族服饰（上）受到匈牙利（下）的影响
另一方面，斯洛文尼亚人抗击阿瓦尔人有了结果。阿瓦尔人在9世纪被东罗马帝国和东法兰克王国联合灭亡，融入其他民族。
不久之后，东法兰克王国被神圣罗马帝国所取代，奥地利的哈布斯堡家族在14世纪取得帝位后，同时也成为了斯洛文尼亚人的统治者。继巴伐利亚公国后，斯洛文尼亚人再次被纳入日耳曼人（德意志）的势力范围。
奥斯曼土耳其帝国在15世纪进军巴尔干半岛，先征服了半数的南斯拉夫民族地区（塞尔维亚），再攻占君士坦丁堡，灭亡了东罗马帝国，然后向基督教世界扩张。
▲奥地利帝国是欧洲的主要强国
奥斯曼帝国的兵锋一度到达奥地利首都维也纳，基督教世界不得不联合起来抗击奥斯曼的扩张。处于最前线的克罗地亚和匈牙利元气大伤，大部分领土被奥斯曼占领。斯洛文尼亚虽然没有直面战争，但也处在奥斯曼的威胁之下。
1526年，为了应对奥斯曼这个伊斯兰教帝国的威胁，匈牙利（包括克罗地亚）选择归顺实力更强且同样信仰天主教的奥地利，形成了奥地利与奥斯曼对峙的缓冲区。
▲匈牙利-克罗地亚地区是天主教抵挡奥斯曼帝国的前线
至此，三个主要的南斯拉夫民族都进入了相对的稳定期，信仰东正教的塞尔维亚挣扎在奥斯曼帝国的铁蹄下。克罗地亚和斯洛文尼亚先后成为奥地利哈布斯堡的范围，可以算是殊途同归，但前者是匈牙利的附庸，受匈牙利的影响很深；而后者被奥地利直接管辖，因此斯洛文尼亚深受德意志文化的影响。
四、重新团聚
随着奥斯曼帝国的衰落，以及19世纪初爆发的拿破仑战争，民族解放意识在三个南斯拉夫民族中生根发芽。被信仰伊斯兰教的奥斯曼帝国统治的塞尔维亚人，遭受的压迫最沉重，因而爆发出强大的战斗力，首先在1815年取得高度自治，实际已摆脱奥斯曼帝国的统治。
克罗地亚和斯洛文尼亚因为与奥地利哈布斯堡同属天主教阵营，独立意识虽不如塞尔维亚那么强，但随着奥斯曼帝国的衰落，奥地利和克斯的共同利益正在逐渐减少，所以克斯独立情绪也在增强。
再加上塞尔维亚以同为南斯拉夫人的名义，不断鼓动克斯两族联合建立“南斯拉夫国家”，从而引起了奥地利的警惕。
▲在俄国和奥匈帝国积极支持下，巴尔干民族19世纪纷纷独立
奥地利哈布斯堡统治下的疆域是个多民族的混合体，包括了主体民族德意志人，以及匈牙利、斯拉夫等其他非德意志民族。
害怕克斯两族脱离会引发其他非德意志民族的独立潮，哈布斯堡刻意安排斯洛文尼亚人移民到原属于克罗地亚的伊斯特里亚地区，人为制造两兄弟之间的矛盾。
斯洛文尼亚得到了亚德里亚海出海口，又位于意大利地区与巴尔干半岛的必经之路上，商业和文化都得到较快的发展，是最富裕的南斯拉夫民族，并开始大量吸收意大利地区的文化，与克罗地亚的文化差距进一步拉大。
