大部分慢性肾脏病的主要病因是免疫异常，从而产生免疫复合物、免疫炎症损伤肾脏，导致尿蛋白漏出，治疗也常常从免疫入手。
「免疫抑制剂」可以抑制人体免疫系统，阻止过于活跃的免疫系统损伤肾脏，快速而有效地降低尿蛋白，保护肾功能、减缓肾衰竭进展，是最强力的慢性肾脏病治疗药物。
1.经典的免疫抑制剂
包括：
老牌、便宜、征战半个多世纪至今仍活跃在一线的环磷酰胺；
降低尿蛋白见效快的他克莫司；
当其它免疫抑制剂效果不理想时的底牌：环孢素；
还有90年代后期才应用于临床的新锐药物吗替麦考酚酯；
以及副作用小、安全性高的来氟米特；
等等。
2.糖皮质激素
也就是肾友们常用的激素药物，比如泼尼松、甲泼尼龙等，名称中带有“可的”“泼尼”或是“米松”。价格便宜，副作用可控，常用作首选药物。
3.雷公藤多苷
雷公藤多苷是从中草药“雷公藤”中提取出的、具有抑制免疫作用的成分，可用于多种肾病。
4.单抗类药物
一类单克隆抗体药物，比如利妥昔单抗、贝利尤单抗等等，费用较贵，但疗效突出。
1.治疗微小病变
由于10个儿童肾病综合征患儿，有9个是微小病变肾病，所以一般不需要肾穿刺。使用糖皮质激素治疗15天到2个月内，尿蛋白会转阴，显效率极高。
激素会带来多种副作用，比如变胖、骨质疏松甚至股骨头坏死等等。如果担心激素的副作用，可在医师指导下尝试单纯免疫抑制剂治疗，比如单纯环孢素治疗，可避免激素的副作用，疗效和激素类似。
由于尿蛋白容易控制，肌酐升高也可以恢复，预后一般较好。规范治疗的微小病变患者，肾脏病变可恢复正常，也就是说可以完全治愈。
2.治疗膜性肾病
膜性肾病单用激素无效，需联用其它免疫抑制剂，首选环磷酰胺，次选其它药物，如来氟米特、吗替麦考酚酯、环孢素A及他克莫司等药物。
如果激素不适用，可单用环孢素或他克莫司。
少数患者应用上述药物不见效的时候，可以考虑使用利妥昔单抗，显效率更高。该药能进一步提高缓解率达60%～65%；也可考虑贝利尤单抗，显效率与利妥昔单抗相当，而显效时间更快。
3.治疗局灶节段性肾小球硬化
一般推荐足量长期（建议12周以上）激素治疗，效果不明显时还可加用环孢素，60%的患者的尿蛋白会得到缓解。如果无明显疗效，可使用立妥昔单抗，显效率更高。
局灶节段性肾小球硬化患者要小心药物副作用。因为这种肾病往往必须用免疫抑制剂，不用不行，而且要长期大剂量用激素。激素、环孢素治疗期间应严密观察病情变化，特别需要高度警惕其可能发生的严重副作用。
4.治疗IgA肾病
尿蛋白较高的IgA肾病，常用激素治疗。
但是，IgA肾病很有“韧性”：如果尿蛋白较高，用激素后尿蛋白下降幅度不太大，很多患者降不到24小时尿蛋白定量0.5g以下的安全范围。和较大的副作用相比，获益不多。
治疗IgA肾病，可以用“来氟米特 小剂量激素”方案，比足量激素更加安全且有效。（小剂量激素是指泼尼松片20mg/日，或甲泼尼龙片16mg/日）。
除了以上肾病外，免疫抑制剂治疗狼疮性肾病、紫癜性肾病等继发性肾病也有显著的疗效。
最后要说的是，治疗慢性肾脏病，尽管免疫抑制剂是众多药物中效果最强的，但仍有一部分患者使用免疫抑制剂后效果不明显，或是尿蛋白下降后又出现复发。所以免疫抑制剂还不能算是真正的特效药，只能是带引号的“特效药”。
严格意义上讲，慢性肾脏病没有一用就能治好的特效药。实际的临床治疗中，大量蛋白尿患者采取中西医结合治疗，免疫抑制剂联合中药效果更好，中药可提高疗效、减轻西药副作用、降低复发率。
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