现在寺里还有达摩井，航海碑。达摩生于南天竺，传说他曾是南天竺国的王子，出家后倾心大乘佛法，为印度禅宗第28代祖师，远渡重洋，在海上漂泊了三年之后来到中国，四处传播佛家思想。最终因开创佛教传宗而闻名天下。达摩被人称为“大乘佛教，中国传宗的始祖”。光孝寺也成为中国传宗的起点。
在达摩离开光孝寺一百多年后，另一位中国佛家史上的传奇来到了光孝寺的菩提树下。
公元676年，唐高宗天皇大圣大弘孝皇帝仪凤元年，高僧惠能慕名前来那一年的四月初八，惠能法师在光孝寺落发，他留下了风动和心动的哲学。那一天是佛祖释迦牟尼的诞辰纪念日，光孝寺正在召开法会。一阵风吹来，寺院里的经幡随风飘动，印宗法师看到此景，就让大家献享陈诉法意，以两位出家人为代表，各执一词，一个说是幡在动，一个说是风在动。这时惠能站出来说到“这不是幡在动，也不是风在动，仁者，心在动”。此言一出，震惊四座。从此惠能在光孝寺开辟佛教南宗，被称为“禅宗六祖”。
为纪念惠能，信徒在光孝寺为纪念惠能修建了一座瘗发塔。
这座塔有着鲜明的中国特色，塔顶材质为复玻石，就像倒扣的碗，为印度特色塔身以砖石结构勾画亭台楼阁，这是典型中国楼阁式塔。塔有七级，高7.8米，各层各面设佛龛，佛龛里面都安设了一尊佛像，粉墙上隐起红色 木兼 柱、角柱、柬额，柱头坐方栌斗承梁尖而无普柏枋，斗欹下内幽页 下施皿板。
除了瘗发塔之外，光孝寺还保存着两座国家级的建筑西铁塔和东铁塔。
