▲1734年西班牙的菲律宾地图
时间进入19世纪，几百年过去，西班牙作为第一代殖民霸主的地位早已不复从前，而美国作为新一代的列强，对大势早已不复的西班牙所拥有的殖民地垂涎已久。
1898年，为争夺菲律宾的控制权，美西战争爆发，日暮西山的西班牙不敌船坚炮更利的美国人，最终战败。
但在停战条约的签署上，西班牙人耍了个滑头，将其没有实际占领的棉兰老岛也划给了美国，把这坨烂摊子甩给了美国人。
▲美西战争
美国接管菲律宾后，很快发现了南部迥然不同的情况。为完全控制菲律宾，美国人软硬皆施，一边推行对穆斯林的经济政治压迫，以及转化教育；一边发动数次战争，仍然没有成功占领棉兰老岛。
不仅如此，还进一步激发了穆斯林的抵抗决心和独立意识，也加剧了穆斯林与天主教徒之间的矛盾。
▲美式教育走入菲律宾课堂
由于考虑到战争成本过高，美国着手与南部苏丹进行谈判，最终签订了吉兰姆·贝兹条约，苏丹承认美国对其属地的主权，美国则要承认苏丹对于当地的统治。
美国象征性地取得了棉兰老岛的统治权，但棉兰老的穆斯林则保留一定的自治权。
▲美军对于摩洛人的屠戮
之后的几十年间，美国对菲律宾也采取了一贯的分治策略——以北治南，即在保留南部独立特征的基础上维持统治，建立以北部菲律宾文化认同为核心的菲律宾族群形象，并赋予其民族官方地位，这进一步加深了南北关系的裂缝。
美国更是颁布新的菲律宾土地法，宣称南方土地为“非法土地”，计划性地向棉兰老岛迁徙北部天主教居民，以稀化当地伊斯兰为主的宗教构成。
