散热方面，iQOO Neo6 SE升级了叠瀑液冷散热系统，让石墨与高低不同的元件紧密贴合，能分层次地将手机发热立体地散发出去。该机搭载了双电芯80W闪充，内置等效4700mAh电池最快30分钟即可充满电量，连续追剧19小时。
iQOO Neo6 SE主打“深玩”游戏体验，搭载了双十倍触控微操，瞬时触控采样率最高可达1200Hz，“游戏闪电功能”可以跳过开场画面直接进入首页，“游戏预更新功能”可以帮用户自动更新游戏。
该机正面采用了一块三星E4屏幕，峰值亮度可达1300nits，支持100% P3色域、HDR 显示，出色的画面体验再搭配上X轴震感马达、封闭式立体双扬可以为用户带来身临其境的战场体验，本机也获得了KPL比赛用机测试认证。
