这让叶文洁感到惊讶，可她也没有过多关心这件事，她只想逃避外界的纷纷扰扰，过安稳的日子。于是，她安心留在了红岸基地，并和杨卫宁结了婚。
叶文洁本以为自己的生活可以一直平静下去，可她却在无意间发现了通向新世界的大门，她竟然和一个叫三体的文明取得了联系。
第一次联系上后，叶文洁收到了一条“不要回答，不要回答，不要回答”的电波，她怀着忐忑不安的心情向领导隐瞒了这件事。
可四年之后，叶文洁再次收到了来自三体的信号，这一次，她直接发出了一段话：“到我们这里来吧，我们的人类已经无药可救了……”
电波发出不久，就有领导察觉到了这件事，为了隐藏自己的行径，叶文洁不惜害死了自己的丈夫杨卫宁，自己一个人带女儿生活。
多年以后，国家对错误的思想进行了“拨乱反正”，红岸基地也废弃了，叶文洁被调到一所学校教书。
叶文洁在无意间认识了美国的伊文斯，他和叶文洁一样对人类世界失望，叶文洁再三犹豫之下将自己联系过三体世界的事告诉了伊文斯。
伊文斯很快便用自己丰厚的财力建造了第二个红岸基地，开启了自己反人类的伟大事业，并邀请叶文洁入伙，就这样，叶文洁再次被卷入可怕的漩涡，最后被捕入狱，她将这些匪夷所思的事情公布于众。
接下来，人类为了生存，开始想尽一切办法，采取各种措施与三体文明进行抗争，在被逼到绝境后，人类不得已采取极端措施与三体文明同归于尽。
叶文洁最后终于意识到自己背叛人类是一个极大的错误，所以她将自己毕生对宇宙社会学的研究，全数托付给年轻人，通过另一条路去挽救岌岌可危的地球社会。
整个故事充满了无尽的想象力，惊奇不断，高潮迭起，扣人心弦。这也是《三体》会受到大家追捧的一个重要原因。一个跨越较长时间的精彩的夹杂着科幻元素的故事。
事实上，《三体》也确实如吴国盛所说的那样，科幻元素只是表面，吸引读者的还是其中无处不在的人性：善与恶的选择，背叛与信任的抉择。
在《三体》中，叶文洁是唯一一个被勾勒出完整人生轨迹的人物，是故事的主线人物，她的人物形象很是立体饱满。
首先，叶文洁的内心充斥着“爱”与“恨”的矛盾。
叶文洁父亲的惨死是她转变信念，对人性产生恨的起源，母亲和妹妹的“大义灭亲”更增添了她的恨，也让她多人性感到失望。
在经历了心仪之人的背叛后，叶文洁的心开始变得麻木，她已经没有了精神层次的追求，只有恨意支撑着她继续生活。
但后来，她在感受到齐佳屯村民对自己的善意后，她坚固的心开始有所动摇，恨意开始被冲淡，她陷入矛盾。
社会秩序的恢复本让她看到了希望，可母亲，以及当初害死父亲的人根本没有任何悔悟，还将所有的过错推卸给特殊的社会环境和历史阶段，将自己归为受害者。
这让叶文洁意识到，人类缺乏道德自觉，他们犯了错之后，本能只会让他们推卸责任，而不是反思与改正，她再次看到了人性的冷漠和卑鄙。
叶文洁就在这种对人性“爱恨交织”的状态下纠结矛盾。
叶文洁选择联系三体文明，一开始也并非是为了毁灭人类，发泄自己的恨意，而是抱着让外星文明改变人性，拯救人类的想法邀请三体文明来地球的。
只是，她过于天真，这样的做法并未能拯救人类，反而还将人类推向了更恐怖的深渊，这是她一开始没想到的。
其次，叶文洁的内心还有着“善”与“恶”的矛盾。
叶文洁本性是善良正直的，面对父亲的遭遇，虽然她无能为力，无法将父亲救下，但她并没有像母亲和妹妹一样选择明哲保身，反而是愤愤不平。
后来，面对上层对父亲的不实控告，叶文洁也没有像母亲和妹妹一样“识时务”，而是宁死不屈，坚决不签字。
