由于感染性的毛囊炎病原菌来源很多，为了进一步确诊，是由真菌还是细菌感染引起，可能需要进行血常规、涂片检查、组织病理学检查等。
赖梅生表示，血常规中主要看白细胞计数、中性粒细胞计数和淋巴细胞计数的变化，分辨是否存在炎症，而涂片检查则是取脓液进行涂片检查，可以判断有没有细菌感染，还可以明确引起感染的病原菌。
确诊后，如果是细菌感染而形成的毛囊炎，一般可以口服罗红霉素或者头孢氨苄，头孢丙烯等等都是可以的，但是如果是真菌感染而形成的毛囊炎，那么就要口服一些抗组胺药物，同时需要口服一些抗真菌的药物，比如可以口服伊曲康唑进行抗真菌治疗，同时局部的也需要外涂复方酮康唑乳膏等。
由于都可以在脸上发病，因此不少人把痤疮和毛囊炎相混淆，赖梅生指出，患者可以从以下几点来鉴别。
首先毛囊炎是因为毛囊激发了细菌感染，而痤疮则是因为皮脂腺的问题，是身体里面内部病变造成。
其次，痤疮一般常见部位为额头和脸颊这些皮脂腺分泌旺盛的地方，而且为多发性的，而毛囊炎起初为红色丘疹后会转变为脓包，且为孤立散在颈部、面部、四肢、臀部等毛发旺盛的地方。
最后，一般痤疮在后期会在皮肤上出现黑色素沉淀，严重的还会产生疤痕，而毛囊炎则不会，在治疗上对于毛囊炎只需抗菌治疗，而痤疮的治疗则更为复杂。
出现毛囊炎后，不仅仅是用药这么简单，日常生活中也有不少方面需要注意，专家提醒：
