1.萨顿的假说，基因和染色体的行为存在着明显的平行关系，他用类比推理法推测，基因在染色体上。
2.摩尔根用假说—演绎法，证明基因在染色体上。
3.摩尔根用果蝇为研究材料，因为果蝇易饲养，繁殖快，染色体数少。
4.摩尔根偶然在一群红眼果蝇中发现了一只白眼雄果蝇。且白眼的现状总是与性别相关联。
5.果蝇有四对染色体，三对是常染色体，一对是性染色体。果蝇的Y染色体比X染色体要长。
6.一条染色体上有许多的基因。基因在染色体上呈线性排列。
7.基因的分离定律的实质，在杂合子的细胞中，位于一对同源染色体上的等位基因具有一定的独立性，在减数分裂形成配子的过程中，等位基因会随同源染色体的分开而分离，分别进入配子中，独立的随配子遗传给后代。
8.基因的自由组合定律的实质：位于非同源染色体上的非等位基因的分离和组合，是互不干扰的，在减数分裂过程中，同源染色体上的等位基因彼此分离的同时，非同源染色体上的非等位基因自由组合。
9.并非所有的非等位基因自由组合。
