1.光照
藻类吸收光能进行光合作用，光照强度和光照时间会影响藻类的生物量、密度。适宜的光照强度是藻类生长繁殖的基础。不同藻类利用的最适光照强度不同，有研究表明微囊藻适宜低光照，而栅藻适宜较高的光照强度，因此，藻类因光照需求的差异往往表现出水层分布的差异。
2.溶解氧
水体中溶氧量与藻类呈显著正相关。淡水养殖水体的溶解氧有86%来自于藻类光合作用，海水养殖池塘91.3%~100%的溶解氧来自于光合作用。对水体耗氧研究表明，处于迅速生长的藻类，每天呼吸耗氧量为其产氧量的10%~20%，对池塘水呼吸耗氧的调查显示，藻类占水呼吸耗氧19.1%，浮游动物占23.5%，细菌耗氧占57.4%。
3.透明度
透明度是指光透入水中的深浅，与藻类的生长繁殖也息息相关。透明度取决于水体浮游生物和悬浮物的量，所以在一定程度上可以反映水体中藻类的多少。
4.营养盐
营养盐是养殖水体藻类的物质来源，在其他水环境因子适宜的情况下，藻类生物量取决于水中营养盐含量，不同营养水平的水体藻类的组成、优势种、生物量等表现出不同的特征，一般藻类的生物量、密度等会随营养物质的增加而增加，而且基本上蓝藻会形成优势种群，绿藻、硅藻的数量也会较多。一般来说，当有效氮的浓度在0.03~1.3mg/L之间，有效磷的浓度保持0.04~0.05mg/L时，藻类的生物量会增加。
实际生产中，养殖水体由于养殖密度大，投料频繁，代谢废物积累而影响鱼塘水质，通常在养殖中后期，由于投饵、施肥及水体中养殖动物的排泄等原因，有机物不断积累，水体氮、磷等营养盐过量而造成水质恶化，亚硝酸盐含量严重偏高。藻类群落的变化与水体中各项理化因子的变化有密切关系，藻类通过吸收营养盐，加速水中氨氮、亚硝酸盐、氰化物等有毒物质的氧化，降低其含量，因而藻类在一定程度上可作为水质改良剂来改良养殖鱼塘的水质。
