造价昂贵：为了回收成本，磁悬浮的定价相对较高。上海磁悬浮30公里总投入将近100亿，其建设和维护成本较高1。
2. 科技含量高：磁悬浮列车在运行过程中使用的科技含量较高，如悬浮、导向等装置，这些都需要较高的研发投入和技术支撑，从而导致其价格相对较高2。
3. 速度和运力：磁悬浮列车的速度非常快，其从龙阳路到浦东机场的运行时间仅为地铁的六分之一。然而，磁悬浮的运力相对较小，这也可能导致其价格相对较高。
上海磁悬浮专线全长29．863公里，造价89亿人民币，单价2.98亿/公里。高铁造价2008时大约为1.3亿/公里。地铁造价大约4.5亿/公里（以上造价不包含征地补偿等其他费用）。另外磁悬浮列车技术还未成熟，电磁辐射对周边居民及环境的影响比较大，上海磁悬浮沿线居民的身体、
睡眠，甚至电视都受到了磁悬浮的影响，另外磁悬浮的维护费比较高，票价较贵。上海龙阳路~浦东国际机场，坐地铁2号线为6元。如果有高铁的话，根据高铁票价计算公式应该是29.863*0.45=13.44元。而磁悬浮票价以前为80元后降为50元。世界第一条磁悬浮商业运营线其实只能算是上海的一个形象工程。
