在炮塔的设计上，99A主战坦克并没有使用传统的铸造炮塔，而是使用目前国际上比较主流的焊接炮塔。
之所以没有延续一直以来使用的苏式鹅卵型铸造炮塔，是因为国际上已经出现更加出色的新型穿甲弹和复合装甲。
采用传统的铸造炮塔改进的空间小，而焊接炮塔有利于布置大厚度、大倾角的复合装甲模块，并且还方便加挂爆炸反应装甲，是目前增强炮塔防护性有利手段，基本上国际上都采用这种方式。
炮塔正面设计成新型钝角楔形装甲，一样在炮塔主体装甲外设计约束陶瓷复合装甲，并加挂新型双防反应装甲，正面的防御能力一样超过1000mm均质钢装甲的防御水平。
