常州大学在第四轮学科评估中，最好的学科为化学工程与技术，被评为B-，另有计算机科学与技术被评为C ，具体可见下图！
从优势学科来看，两校优势学科大致相当！
两校历史起源与规模常州大学始建于1978年，前身为南京化工学院无锡分院、常州分院。1981年经国务院批准，学校定名为江苏化工学院；1992年成为中国石油化工集团公司管理的部属院校，并更名为江苏石油化工学院；2002年更名为江苏工业学院；2010年更名为常州大学。
常州大学有本科专业80个，一级学科博士学位授权点2个、一级学科硕士学位授权点15个、专业学位类别7个！
南通大学始建于1912年，源自近代著名实业家、教育家、政治家张謇先生创办的私立南通医学专门学校和私立南通纺织专门学校。2004年5月经教育部批准，原南通医学院、南通工学院、南通师范学院三所省属公办本科院校合并组建新的南通大学。
南通大学拥有3个博士后流动站，5个一级学科博士点，23个一级学科硕士点，19个专业学位硕士点；6个学科进入ESI全球排名前1% ；开设105个本科专业（2021年招生专业77个）！
从硕士博士数量来看，南通大学实力更强一些！
两校综合排名对比2022年软科江苏高校排行榜中，常州大学位居全国第158位，江苏高校第19位，南通大学位居全国高校第169位，省内第20位！
