深圳北站是深圳地铁4号线、深圳地铁5号线、深圳地铁6号线换乘车站，最晚地铁往返方向分别为：
地铁4号线(龙华线)深圳北站末班车时间：
(往福田口岸方向)23:12;
(往牛湖方向)23:20
地铁5号线(环中线)深圳北站末班车时间：
(往黄贝岭方向)23:47;(往赤湾方向)23:34;
法定节假日推迟1小时停运：(往黄贝岭方向)00:47;(往赤湾方向)00:34
地铁6号线(光明线)深圳北站末班车时间：
(往科学馆方向)23:52;
(往松岗方向)23:18
地铁4号线(龙华线)深圳北站末班车时间：(往福田口岸方向)23:12；(往清湖方向)23:20
地铁5号线(环中线)深圳北站末班车时间：(往黄贝岭方向)23:32；(往前海湾方向)23:34
