然而他这样连续大规模的削藩，非但没有起到震慑他人的作用，反而使得他在王室中人心尽失，间接造成后来朱棣造反时大批藩镇望风而降，不仅如此最后当朱棣兵临南京的时候，打开门放他进来的就有谷王，与此同时削藩的行为也是朱棣起兵造反的主要原因。然而如果只是这样即便朱棣造反也依旧不是朱允炆的对手，因为双方的实力差距实在是太大，大到一开始没有任何人相信朱棣能成功。
首先在朱棣造反之前，朱允炆实际上就已经大大削弱了他的势力，比如据《明史》记载，上命都督宋忠调缘边官军屯开平，选燕府护卫精壮隶忠麾下，召护卫胡骑指挥关童等入京以弱燕，紧接着又复调北平永清左 右卫官军分驻彰德 顺德，都督徐凯练兵临清，耿瓛练兵山海关以控制北平。由此可见朱棣早在起兵之前就遭到了架空，其手下的精兵强将也基本上被调离，那现在我们再来看朱允炆手上有多少兵马。就拿当时北方来说，除开朱棣手下的北平二都司，朱允炆手上还有辽东 陕西 山西等七个都司可以调兵，而这些地方由于担负着边防重任，兵力自然不会太少。
例如其中陕西有十万六千人，山西有六万五千五百人，辽东有十万三千五百人，而最后林林总总加起来仅上面提到的几个地方，总兵力就多达五十万人，而另一边朱棣在起兵时仅有府上亲兵八百人，而最后即便他夺回旧部并联合宁王后，总兵力也才二十万左右，而当时整个明朝上下总兵力多达两百万之巨。由此可见仅从兵力上朱棣就绝无可能打过朱允炆，因此在前期他为了向朱允炆示好，还不惜将自己的三个儿子都送到南京当人质，然而就是在这种情况下朱允炆依旧打输了，而说到这就不得不提到一个人，他就是李景隆。起初朱棣起兵之时，朱允炆派出的是老将耿炳文，而耿炳文虽然当时已经65岁高龄，但依旧建立起了坚固的防线，使得朱棣虽然表面上连战连捷，但实际上却没有占领多少地盘，也就是说只要就这么耗下去，就算一仗不打都能活生生耗死朱棣。
然而朱允炆偏偏不这么想，他就要主动出击，于是在黄子澄的建议下，他换上了跟自己有着表亲关系的李景隆，而这绝对是他干过最失败的一件事，因为李景隆从来没有指挥过大规模战役，而朱允炆一上来就给他筹集了五十万大军，而后来在围攻北平的战役中，都督翟能率人将城墙打出了缺口，而李景隆在这种情况下非但不马上让周围军队进攻，反倒是自己慢悠悠的率兵赶来，结果一晚上过去人家又把城墙给修好了。而紧接着朱棣率领着朵颜三卫骑兵直接抄了他的后路，结果李景隆直接丢下大军跑了，直接导致五十万大军群龙无首四散而逃，然而就算是这样朱允炆居然也没有放弃他，他后来又给李景隆筹集了六十万大军，让他在济南一带驻防，结果要不是后来的盛庸和铁弦死守济南城，估计朱允炆当场就可以考虑自焚了。
