1921年，桂系军阀被驱逐之后，广东革命政府成功组建。此时何香凝与廖仲恺也已经回到国内。廖仲恺被任命为革命政府财政部次长，之后又任财政厅长，从背后为革命提供了有力后盾。
同年，陈炯明在广东发动六一六事变，为了第一时间阻止孙中山等人有反抗之力，陈炯明首先就将主观财政部的廖仲恺逮捕。廖仲恺被捕后，何香凝意识到了事态的严重性，陈炯明叛变了。
何香凝心知丈夫应当一时半会不会有什么危险，于是她首先去寻找孙中山和宋庆龄夫妻二人的踪迹。第二天当她查到孙中山先生的踪迹之后，便立即与孙中山见面，建议孙中山去上海暂时避难。而当孙中山让何香凝与其一同前去上海时，何香凝毅然回绝，她表示要返回广东营救丈夫。
何香凝返回广东自后，陈炯明找到何香凝，提出了以廖仲恺交换孙中山行踪的条件，何香凝自然是一口回绝，并且当着陈炯明的面破口大骂，骂陈炯明是革命的叛徒。
陈炯明内心自知理亏，他也知道何香凝是个不好惹的刚烈性格，更加不好与何香凝直接撕破脸皮，于是只能不再追究此事，此后的一段时间内也有意无意的在回避何香凝。
但陈炯明也没能因此安生，何香凝反而跑过来找他理论。1922年8月，陈炯明在白云山召开会议时，何香凝冒着大雨来到会场，见面便是对着陈炯明劈头盖脸的一顿怒斥。
陈炯明虽然内心怒不可遏，但他有许多把柄掌握在何香凝的手上，同时也受过何香凝夫妇二人不少恩惠。比如当初陈炯明的军队缺量少饷之时，不是何香凝她们筹款帮助，陈炯明早不知到哪去了。
因此，何香凝在会场上痛骂陈炯明以及一种军官叛党行为之时，他们只能低头无话可说，碍于面子，又为了不让自己的手下心生二心，只能把对自己有恩的廖仲恺给释放。
廖仲恺被释放之后，第二天一早，夫妻二人便乘坐小船偷偷地离开，随后又迅速转移到了香港。
1925年，住在北平的孙中山先生因病重即将离世，何香凝前去探望之时，孙中山将自己的遗孀宋庆龄交给何香凝来保护，并且嘱托何香凝，一定要把革命的事业进行到底，要将革命的初衷贯彻到底，何香凝毅然答应了孙中山先生的要求。
三、坚定革命理想孙中山先生逝世之后，蒋介石等党内右派陷入*乱之中，中山先生的离世对他们来说无疑是一次夺取党内大权的绝好机会，但他们还有一个“麻烦”需要解决，那就是一直与共产党保持着良好合作关系的党内核心人物——廖仲恺。
1925年8月20日，党内传来消息，让廖仲恺与何香凝火速前往中央。接到消息的二人，马不停蹄的赶去，没想到，在即将踏入大门之时，一颗子弹呼啸而过，击中廖仲恺，廖仲恺先生应声倒地，就这样惨死在蒋介石等人之手。
