在有美国大使馆的城市，愤怒的民众冲到了美国驻华大使馆外，向里面扔石块、投放燃烧瓶，中方还为此派出警察维护秩序，但警方到达现场后也没有阻拦示威，只是没让民众冲进大使馆。
当时还闹出一件让两国都意想不到的事情，中国的爱国黑客们（红客）在事件发生后大肆进攻美国网络，中美网络大战一触即发，双方都在对方的数百个网站上插满了对方的国旗，火药味极浓。
人民群众群情激奋，我国高层亦是愤慨，外交部在5月8日便发出声明，谴责北约组织的残酷暴行。
张万年
同时，中央军委副主席张万年召开中央军委扩大会议，紧急部署，全国军队进入一级备战状态，军方停止与美方的所有军事合作活动，同时宣布：做好随时打仗的准备！
中方的一系列动作让原本有恃无恐的美国逐渐动容，此时科索沃战争还没有结束，美方面对中方举国愤慨的情绪，开始认怂。
一时的隐忍，只为日后更加强大轰炸事件当天，美国国务卿奥尔布赖特急匆匆地赶到驻美大使馆，在与驻美大使李肇星的商谈中，她一方面表达歉意，一方面企图将大事化小小事化了。
但奥尔布赖特的道歉显然缺乏诚意，李肇星面色阴沉，表示美国必须负担起全部的责任，向世界、向中国人民坦诚罪行，赔礼道歉。
在李肇星等人的强硬要求和舆论的巨大压力下，奥尔布赖特被逼着在大使馆外面对诸多记者的摄像机发表道歉。
奥尔布赖特
随后，中方的军事备战和国内的舆论让美方不得不考虑与中方交涉。
当时的美国虽然在军事实力方面远超中国，但从历史上看，美国与中国的交锋并没有占到过便宜，如今在科索沃战争的关键时刻，如果与中方再度爆发战争，无论是美方还是中方都没有好处。
于是，在同年5月12日，美国总统克林顿用书面形式发表郑重声明，向中方表达自己对死难者的哀悼和歉意，并愿意同中方协商赔偿。
到12月16日，中美两方达成协议，中方接受美国政府三千多万美元的赔偿——450万美元（遇难者及受伤人员的赔偿） 2800万美元（大使馆财产损失的赔偿）。
就这样，轰动一时的驻南斯拉夫中国大使馆轰炸事件落下帷幕，此次事件，以美国赔礼道歉为结果而告终。
或许有人会问，当时国内群情激奋，加上经过几十年的改革开放，中国早已经不是过去那个一穷二白的国家了，为什么不与美国干上一场，为轰炸事件中牺牲的同胞们报仇雪恨呢？
想当初抗美援朝的时候，中国也是穷得叮当响，不照样把美国人赶出朝鲜了吗？还有越南战争的时候，我们并没有输给过美方。
但实际上，这些事情都是过去式了，中方当时是基于各种考虑，才选择妥协并接受赔偿这个结果。
在当时，中国因为改革开放，正处于高速发展时期，如果这时候发生大规模战争，会严重拖垮我国的经济运转。
中国是社会主义国家，不像西方发达国家通过掠夺积累原始资本，一旦与美国开战，我国经济发展必然受阻，而美方就算有损失，作为资本大国的美方却也伤得起。
