乾隆强忍泪水，追封令妃为孝仪纯皇后，并写了一首挽诗：“儿女少年甫毕姻，独遗幼稚可怜真。兰宫领袖令仪著，萱戺殷勤懿孝纯。了识生兮原属幻，所惭化者近何频？强收悲泪为欢喜，仰体慈帏度念谆。”
1799年乾隆驾崩，令妃与乾隆合葬于裕陵，对于令妃来说一切似乎已经圆满。
原本故事到这里就结束了，可是153年后的一次意外打破了裕陵百年的宁静。
死因真相1928年，军阀孙殿英盗掘了乾隆的裕陵，对裕陵造成严重的破坏。
溥仪恨不得把孙殿英千刀万剁，他急忙派出前清遗老将先人重新入殓，没成想人们竟发现乾隆遗骨旁，竟有一具保存尚好的女尸。
只见满面皱纹，牙齿未全脱落，皮肤和毛发皆在，面带微笑，栩栩如生，年龄大概50岁上下，经仔细辨认，她的真实身份正是令妃。
为什么时隔153年，令妃的尸体没有腐烂呢？
专家经过检测，在她的体内发现了大量的朱砂，正是这种硫化汞的物质才使得令妃的尸体保存完好。
可是为什么令妃体内存在大量朱砂呢？
这和乾隆有莫大关系，由于他对令妃的过度宠幸，导致令妃连连怀胎生子，即使身体虚弱也要强撑着身体侍寝。
这样的“伤害”，即使是铁打的身体也受不了。
后来令妃上了年纪，伤病缠身，到了晚上经常疼痛难忍，无法入眠。
为此，令妃找御医开了中药朱砂，朱砂具有安神清心之效。
令妃人生的最后十年没有生育孩子，一是她主管后宫，琐事繁杂，二是她的身体已严重透支，全靠朱砂续命。
但朱砂是硫化汞重金属物质，如大量长期服用，犹如吃毒药一般，这使得令妃的死因真相大白。
令妃把持后宫长达十年，早已具备当皇后的资历，为什么乾隆一直不封她为皇后呢？
有一种说法是关乎乾隆秘密立储，在1773年，皇十五子永琰被秘立为皇太子，也许是为了遮掩立储的秘密，乾隆有意让令妃一直保持皇贵妃的身份。
另一种说法是乾隆认为令妃出身低微，她没有资格，当年有位大臣提出册立新皇后，乾隆谕旨回复：“况现在嫔妃中，既无克当斯位之人……”可见他的态度让人寒心。
