这座寺庙的镇馆之物便是圆通宝殿里的三座佛像，汇聚了和见证了整个西南地区的佛教文化，这三座均来自元朝时期所制造的释迦牟尼等古老的佛像，这座寺庙始建于唐朝，原名称之为“补陀罗寺”，但在元朝初期忽必烈征伐云南时被毁于战火，元朝初期又在补陀罗寺的原址上重建，并更名为“圆通寺”，塑造了圆通宝殿中的三座佛像，一直保留至今，见证了云南的佛教史，也延续了一千多年的香火！
历史上圆通寺遭受过多次损坏，也有过多次重修扩建，从明代开始，这座佛教寺庙就被当地政府划入昆明城墙内，并受到当地权贵的关照，逐渐树立起其在云南的佛教地位，清朝康熙年间，平西王吴三桂镇守昆明城，他也是佛教的信仰者，并开始对圆通寺扩建，建立起了“圆通胜境”牌坊和“八角亭”等建筑，并用水榭回廊将八角亭在池中打通一条走廊，连接在两座寺庙中间，这次的扩建，也基本奠定了如今所见的圆通寺格局！
在圆通山的石壁上有一块“衲霞屏”，上面刻有历史上文人墨客留下的笔记，还刻有张三丰和吕洞宾的画像，据传在这处地方还建立过吕祖殿和玄天阁，表现出佛道并存的特点，现如今这里已对外开放用作于游人投币求福的地方！
