在音韵学上，“齿”是指前面的牙，发出的声音为“齿音”；而“牙”是指后面的牙，发出的声音为“牙音”。当然齿音和牙音并不是真用牙齿发出来的。
齿音靠前，接近门齿的位置，所以叫“齿音”
比如“z、c、s”
而牙音靠后，接近臼齿的位置，所以叫“牙音”
比如“j、q、x”
口语和书面语的区别
一般来说，用“牙”都较通俗，用“齿”都偏重书面语或专业用语。
比如，我们口中各种牙齿名字：门牙，上牙，下牙、大牙、小牙、狗牙、槽牙、牙床……是口语通俗讲法。
书刊中正规描述或是医生用语，常说成“门齿、上齿、下齿、大齿、小齿、犬齿、臼齿、齿龈……”
对于口腔医生来说，现在，都统一称之为“牙”了
俗雅习惯和特定的表述
“牙”和“齿”两字意思相同，都可同某字组词，但仍有难以互替的情况。成语中的字动不得，如“唇亡齿寒”不可说成“唇亡牙寒”，“以牙还牙”不能改为“以齿还齿”；普通词语中这两个字也不可任意改动，如“牙齿”当然不可说“齿牙”，“齿轮”说成“牙轮”总有点别扭，若把“牙痛”叫“齿痛”的话，牙医师会莫名其妙或笑得无法看病行医。
这种俗雅习惯也反映在两字其他组词中：
用“牙”者多通俗词语。
例如牙医、拔牙、镶牙、牙膏、牙刷、牙签、月牙、牙口、咬紧牙关、以牙还牙、马路牙子是常用通俗词语。
“齿”多文雅或书面用语。
例如齿冷（指耻笑。意思是嘲讽而笑，因张口笑得太久，牙齿都感觉冷了）、齿孔（如邮票边缘之小孔）、不齿、何足挂齿、唇齿相依、没齿难忘等，明显是雅而不俗的说法了。
