南京二十九中创办于1945年。现已发展成为南京二十九中教育集团，由江苏教育学院附属高级中学（原二十九中高中部）、南京二十九中初级中学、致远中学以及幕府山中学组成。南京二十九初级中学分为龙蟠里校区、石城校区和幕府山三个校区。
随着29中高中的高歌猛进，初中也在渐渐崛起。直升29初的小学，也聚集了南京顶级的生源。学校抓成绩、有效率，家长重教育，与学校配合度高，正向循环之下，学生成绩稳步提升。
中考成绩：
2019年：均为571.6分，10个班级超600。最高分660分，640分以上36人，630分以上73人，620分以上134人，600人以上268人，预计35%进入六大名校，四星级高中达线率超80%，普高达线率90%。
2018年：裸分高达673分，全年级均分584.2。四星达线率预计超过70%，三星达线率预计超过90%。期中有四个班，640分以上的人数均达到班级人数的35%。超过市均分100分以上的共有10个班。
-----玄武区-----
科利华中学
科利华中学创办于 1979 年，2000 年被江苏省教育厅命名为首批省级示范初中。近年来中考成绩稳居玄武区公办校第一、南京市前列，连续十多年获得玄武区教学质量最高奖。
中考成绩：
2020年中考：最高分653分，35人达附中线637分，67人达金中线630分，占比12%。据家长反映，学校没有那么死揪，初一、初二比较松，初三收紧，稳扎稳打，水到渠成。
第九初级中学
南京市第九初级中学，自2011年8月由原南京市第九中学初中部独立分设并更名而来。学校文化底蕴深厚，周边毗邻东南大学、长江路文化一条街等众多文化场所。学校重视物理特色，打造出的“吴健雄”班正是以著名物理学家吴健雄命名，在历次中考中均处于全区领先位次，班级80%学生被九中东大英才班及以上的六大名校录取。
中考成绩：
近年位居玄武区公办校第二，2019年中考四星高中录取率64%。2020年中考650以上2人，六大录取率约20%，四星达线率超60%，连年获得玄武区初中质量最高奖——“教学质量管理优质奖”。
-----秦淮区-----
钟英中学
钟英中学，南京黑马初中！更是秦淮区公办初中的头部学校。创建于1904年，始名“承志”，后更名“钟英”。学校直升生源有三所，游府西街小学，火瓦巷小学和慧园街小学。
2020年8月，钟英中学新街口校区挂牌启用。现在的钟英中学，由校本部和新街口校区组成，其中校本部由北部校区曾公祠原址、中部和南部教学区组成。
中考成绩：
2020年总均分区公布第一，达四星高中线约69%，达附中线近20人，达金中线近50人，达一中线近80人。
2019年中考，钟英总均分570分，也是区公办校第一，出了一位市中考状元。今年（2022年），也有传言中考状元出自钟英中学（暂未证实）。
一中初中部
