肾髓质部分有8~18个有条纹清晰的圆锥形区域，称为肾锥体。肾锥体的底部位于肾皮髓质交界处，顶端形成肾乳头，每个肾乳头正对着一个杯状的肾小盏，肾乳头也是尿液生成排出到肾盏的出口。可通过肾乳头进行内镜观察观察。
肾皮质的厚度约为1cm，内侧与肾锥体的底部接壤，并在肾锥体之间延伸形成肾柱。肾叶间动脉穿过肾柱从肾窦到达外周皮质，在往外周肾皮质穿行的过程中动脉的直径逐渐变小。因此，经皮肾穿刺进入集合系统通常选择经肾锥体进入肾盏，以避免损伤肾柱中较大的血管，导致出血过多，影响手术视野。
肾微观结构是具体行使肾功能的结构，用肉眼是看不见的细微结构。肾的功能的基本单位就是肾单位，成年人一个肾内有40万至 120 万个肾单位。肾单位可以分为肾小体和肾小管，肾小体包括肾小球和肾小囊，肾小管包括了近端小管（可分为区部和直部）、髓袢细段、远端小管（可分为区部和直部）。其中近端小管直部、髓袢细段与远端小管直部连接呈“u”字形，称为髓袢，又称Henle袢或肾单位袢。当然不同的教科书在名称上有所不同，比如有些地区称肾小球为肾丝球，注意区分即可。
肾小球是上皮细胞包绕着的毛细管丛所形成，肾小囊则是由薄的纤维组成，也称为鲍曼囊（Bowman space）。血液经过肾小球的时候，会发生滤过，其速度约为125ml/min，即我们熟悉的肾小球滤过率，这是评估肾功能最重要的指标。当然肾小球并不是一个单纯的血管，将要滤过的血液和肾小囊隔开的有三层结构：单层的内皮细胞、薄的肾小球基底膜及基底膜另一侧的足细胞层。而近曲、远曲小管以及髓襻的管腔均由单层立方上皮细胞所组成。
肾小球滤过液进入肾小囊，也称为原尿，然后进入近曲小管，在经过髓襻的细段和粗段后，再到达与肾小球相邻的致密斑，继续进入远曲小管，然后进入集合管，最终滤过液的90%被重吸收，剩余的部分形成最终的尿液，当然这个过程中肾小管也会分泌一定的其他物质，终尿从集合管进入肾盏，然后到肾盂、输尿管和膀胱，最后被排出体外。
这些不同的结构有不同的功能，我们后续分析。
参考文献：《坎贝尔泌尿外科学》、A 医学、维基百科
