第一，甲硝唑可以治疗阿米巴肠病以及贾第虫病这两种寄生虫病。
因为阿米巴肠道病和贾第虫病分别属于原虫和鞭毛虫，而甲硝唑具有抵抗这两种虫的功效。阿米巴肠病是由溶组织阿米巴寄生在肠道中，溶解肠道组织引起痢疾，所以也称作痢疾内变形虫，而甲硝唑之所以可以直接*灭阿米巴大肠滋养体，是因为甲硝唑本质有“*虫”效果，具体表现为可以直接阻止阿米巴原虫作用在机体的化学反应，所以阿米巴肠病无论是肠内还是肠外疾病，甲硝唑都是很合适的药物
对于贾第虫病，它的全称是蓝氏贾第鞭毛虫病，而贾第虫病是全球有名的危害人体健康的寄生虫病，腹泻是常见而且主要的症状，连续服用甲硝唑一周后腹泻症状会逐渐消失，由于贾第虫主要寄生在十二指肠这种封闭性的消化道内，所以甲硝唑发挥的作用比较大，甲硝唑能够明显对贾第虫的形态结构造成损伤，是治疗贾第虫病的首选药物。
第二，甲硝唑可以治疗滴虫性阴道炎。
滴虫性阴道炎开始的症状人体感觉并不明显，所以没有感觉就不会察觉，而在逐渐缓慢发展的过程中，阴道内会出现一种稀疏的异物，且有一种难闻的味道，呈现泡沫状，伴有瘙痒，灼热感。
该病的传播方式主要是性生活，所以在这个方面的卫生需要多加注意。甲硝唑有口服和局部阴道栓两种给药方式。有学者研究这两种方式究竟哪种更好，最终得出一个结论：应用甲硝唑阴道栓对于滴虫性阴道炎的治疗效果很不错，比起口服甲硝唑，直接塞在患病部位内可以有效降低滴虫性阴道炎的复发率，危险性也相对来说比较低。
第三，甲硝唑可以用来治疗口腔科的牙周炎，以及智齿冠周炎的辅助治疗。
甲硝唑有抵抗厌氧菌群的效果，而引起牙周炎的致病菌是以牙龈卟啉单胞菌为首的厌氧菌群，所以甲硝唑能用来治疗牙周炎。
服用甲硝唑的方式也有两种，口服和甲硝唑牙用膜局部用药。
在医学期刊《中国医药指南》中，有学者研究过口服甲硝唑片以及甲硝唑牙用药膜两种方法对于牙周炎的疗效，结论就是：两种治疗方案均能有效作用于牙周炎患者治疗中,但甲硝唑牙用药膜效果更佳。
