由于位于极地永冻土层中，即使意外停电，种子库内的温度也能在至少200年内保持在零摄氏度以下。因其可靠的储存条件和安全设计，这座种子库被视为可以运行到地球毁灭的“末日地窖”。
2014年10月已有多批种子被运到斯瓦尔巴全球种子库储存起来，其中最多的来自保加利亚、哥伦比亚、印度。
这些种子来自全球100多个国家和地区，品种繁多，包括小麦、大麦、玉米、高粱、珍珠粟、茄子、鹰嘴豆和花生等。原产自非洲的许多蔬菜种子，如黄秋葵、苋菜、吊兰和麻锦葵等也在其中。
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