陆地防御：五角大楼周围有一个坚固的围墙系统，任何未经授权的人员或车辆都无法进入。除此之外，五角大楼还有一个专门的爆炸物检测系统，可以检测和排除任何可能携带爆炸物的人员或物品。这个系统由X光机、金属探测器和犬类组成，可以有效防止爆炸物袭击。
网络防御：五角大楼内部有一个独立而封闭的网络系统，任何未经授权的电子设备都无法接入。除此之外，五角大楼还有一个专门的网络安全系统，可以检测和抵御任何可能发起的网络攻击。
虽然五角大楼有着如此完善而强大的防御系统，但它并不是铜墙铁壁，它也曾经遭受过多次严重的攻击，甚至有些攻击差点让它毁灭。
五角大楼最著名也最惨痛的空中攻击就是911事件，当时一架被恐怖分子劫持的客机撞向了五角大楼的西侧，造成了184人死亡，包括125名五角大楼工作人员和59名飞机乘客。
这次攻击暴露了五角大楼的空中防御系统的漏洞，即对于低空飞行的飞机无法及时发现和拦截。在这次事件后，美国国防部加强了五角大楼的空中防御能力，增加了雷达和导弹的覆盖范围，提高了拦截器的反应速度。
1972年的炸弹袭击是五角大楼遭遇的最严重也最危险的陆地攻击，当时一个名为“天气地下组织”的极左翼组织在五角大楼内部安置了一个炸弹，并在爆炸前打电话警告。
这次爆炸造成了五角大楼的一部分损毁，幸好没有造成人员伤亡。这次攻击暴露了五角大楼的陆地防御系统的漏洞，即对于内部人员和物品的安全检查不够严格。
