虽然人们一直在利用碧玺。对碧玺的科学认识还停留在几百年前。据说1703年一个温暖的夏日，荷兰阿姆斯特丹的孩子们在玩水手们带回的石头。其中一个孩子突然发现石头在啜饮附近的尘土和草屑。惊讶的孩子们立刻叫他们的父母来观看。研究发现，这种石材具有吸附灰尘和其他轻物体的性能。从此，荷兰人将这种矿石命名为“吸灰石”。直到1768年，著名的瑞典科学家林恩发现了碧玺，人们才确定当时那些小孩儿玩的正是碧玺
碧玺产于地壳中，通常离地表数百公里。其主要成分来自地壳与上地幔之间的软流圈。含不同碧玺成分的伟晶岩热液和花岗质岩浆在洗出地壳的过程中逐渐冷却结晶，形成古老变质岩脉。后来，强烈的风化剥蚀使堤防裸露，进一步遭受自然侵蚀。后来，相对坚硬的矿物，包括碧玺，则被留了下来。它们以冲积物的形式在流域内富集。该矿床为次生矿床。这个过程将花费数亿年的时间。这种成因最典型的碧玺矿床是巴西的米纳斯格拉斯地区，当地伟晶岩的年龄约为4.9亿年。
我国阿勒泰地区的碧玺矿床与巴西不同。主要为原生矿床，属花岗伟晶岩型。碧玺矿的结晶环境与巴西大不相同。脉状交代作用（热液和围岩的化学变化和交代）强烈的地段含有大量稀有金属元素，在结晶过程中通过同构置换形成彩色碧玺晶体，一般来说黑色碧玺是在较高温度环境下形成的，而绿色和粉色碧玺的结晶需要较低的温度。阿勒泰部分碧玺矿石产于结晶溶洞中，与叶理化钠长石、锂云母和晶体密切相关。
世界上很多国家都有碧玺的生产，如巴西、斯里兰卡、缅甸、俄罗斯、意大利、肯尼亚等，但颜色鲜艳的高档宝石级碧玺大多产自巴西，市场上50%-70%的彩色碧玺产自前母抵达的巴西米纳斯吉拉斯。巴西的帕拉伊巴州也生产一种特殊的蓝色碧玺。它被称为“帕拉伊巴碧玺”，是最值钱的碧玺，每克拉售价2万美元。
此外，巴西以其丰富的红色、绿色碧玺和碧玺猫眼而闻名；美国以高品质的粉红色碧玺闻名；俄罗斯乌拉尔地区出产的一种红色碧玺被称为“西伯利亚红宝石(Siberian-ruby)”。
我国内蒙古，阿勒泰、云南等地也有碧玺矿床。虽然产量和品位均低于巴西，但仍具有相当的经济价值。阿勒泰碧玺颜色鲜艳，晶体大，颜色多样，有红、绿、蓝三色，还有一种罕见的“西瓜碧玺”，内部红色，外环为深绿色就和西瓜很像。还有像内蒙古碧玺质量良好。绿色尤其珍贵。
中低档碧玺因其外观与水晶相似，在过去经营水晶的商店中经常出现，因此很多人认为碧玺是一种水晶，甚至有人说它是“水晶之王”。
然而，碧玺和晶体的矿物组成是完全不同的。晶体矿物名称为“石英”，主要成分为二氧化硅；碧玺矿物名称为碧玺，是一种成分极其复杂的硼硅酸盐。
目前，碧玺的价格远高于水晶。究其原因，与宝石的“美、耐久、稀有”三大特征密切相关。首先，碧玺的颜色比水晶的颜色要多，它的光泽也比水晶强。除“耐用性”外，水晶的莫氏硬度为7，碧玺的莫氏硬度为7-8，也高于水晶，因此对异物和空气侵蚀的抵抗力更强。最后，有人说“稀有”，石英是地球上主要的造岩矿物之一，相比之下，晶体产量极高；而碧玺只产于特定地区，特别是生产优质碧玺的情况极为罕见。
此外，碧玺的磁场是同色晶体的几十倍至100倍，在科学应用中具有更显著的性能。
五颜六色从何来
