能够到达上海南站的地铁线路分别有地铁1号线、地铁3号线和地铁15号线。
其中地铁1号线由莘庄开往富锦路,途径外环路站、莲花路站、锦江乐园站以后到达上海南站。
地铁3号线由上海南站开往江杨北路,其收发站点即为上海南站。地铁15号线,由紫竹高新区开往顾村公园,途径永德路、元江路、双柏路等多个站点以后即可到达上海南站地铁站。
可以乘坐轨道交通3号线。
上海南站共有6座站台，包括1座侧式站台和5座岛式站台，共有11个站台面，其中1～9站台用于停靠普速列车，10、11站台是金山铁路列车专用站台，共12条股道，引入上海南联络线连接沪昆铁路和金山铁路
