因为区域内的行政区划发生了改变，2001年，江苏省政府实施“三淮一体”战略，2001年2月10日，淮阴市更名为淮安市，仍驻清河区；原县级淮安市改设楚州区，驻淮城镇；原淮阴县改设淮阴区，驻王营镇。2012年1月31日，楚州区更名为淮安市淮安区。
2016年6月8日，撤销淮安市清河区、清浦区，设立淮安市清江浦区；撤销洪泽县，设立淮安市洪泽区。
2001年淮阴市改名为淮安市，改市的主要原因是地级淮阴市市区与县级淮安市市区接上了联成了一个城。淮阴这个地名没淮安市好听，淮河流域有淮南市淮北市，它们都属安徽，淮阴有意引淮上阴地，阴地没阳地好，淮阴市的市名与之对比相形见拙。淮安是*总理的故乡，是出中国四大文学名著《西游记》的地方，在历史上名人地位上超过淮阴市。淮安的这个名有安顺意，淮河在解放前经常发水灾，淮阴有易受灾多的隐意。
地名有音义大致相同的必有高低比较，淮安与淮南、淮北、淮阴比名的正义和引伸义都不差。
