发生率最高的是头颈部肌肉功能障碍，包括以下三种情况。
1、枕下肌群的功能障碍
枕下肌群位于枕下颈上深层，虽然很小，却与颈前深屈肌共同维持着上颈椎后缩的姿势，有人认为这种后缩姿势是大多数动物包括人类对恐惧反应的一个十分重要的姿势。
同时由于枕下肌群神经支配高度密集，每个神经元支配的肌肉非常少，为3-5根肌纤维（枕下肌每克肌肉组织中有36束肌梭，臀大肌每克中仅有0.7束肌梭），这些肌肉张力可迅速发生变化，从而可精确调整头颅的位置。
枕下肌群组织中有大量的牵张感受器，当人们用眼睛和内耳水平地引导头部方向时，会对枕下肌群产生一定的张力（其实任何眼睛转动都会在这些枕骨下肌群产生张力的变化），而大脑则自其无数的牵张感受器中读取之，接着反射性地指示其余的脊背部肌肉，组织颈部以下的整个脊椎，因此枕下肌群又被认为是整个脊背部的功能中心，连接着从眼球动作到大脑到脊背部肌肉的信号传入和输出及动作协调性。
可以说如何使用眼睛，特别是如何使用颈部，决定了背部肌肉的张力形式，在临床中很多时候松解枕下肌群往往成为解决肩胛、腰背甚至臀部顽固问题的关键。颈椎功能障碍和头痛患者中，枕下肌群最容易出现紧张而导致上颈椎处于后伸位，触诊枕后软组织可触发头颈痛，还可发现这些软组织出现增厚、紧张和广泛压痛改变，严重者枕下肌群可发生严重萎缩。
因此，当枕下肌群受损时，就可能会出现上颈段曲度变化、肌肉紧张，颈痛，头痛，头的位置控制不好等症状。
2、颈深屈肌的功能障碍：
颈深屈肌包括头长肌、颈长肌、头前直肌和头外侧直肌，它们是颈椎前方最深的肌肉，位于颈椎和上胸椎前方和侧方，主要功能是使颈部屈曲。
其收缩可增加颈椎的压力，颈长肌和头长肌紧邻椎动脉和交感神经链两个重要结构。该肌群和枕下肌群一样有着较多的肌梭，对人体的本体感觉空间定位有着很重要的作用，但常常被人所忽视。
其在挥鞭伤时，颈长肌虽是最易损伤的肌肉，但也经常被忽视。
3、胸锁乳突肌、斜方肌、肩胛提肌等颈椎侧屈肌的功能障碍
现代人由于喜欢侧睡这种睡姿，长时间维持在同一姿势时，在重力的作用下该肌肉群也会出现习惯性缩短，表现出斜颈。其中胸锁乳突肌痉挛是颈部畸形的的主要特征，痉挛性斜颈时肌肉痉挛性短缩是造成畸形的主要原因，常常伴随着斜方肌锁骨部的部分痉挛。
