从以上历史可以看出，佛教在阿克苏乃至西域境内曾长时间占据主流，那为什么今天的新疆多数人信奉伊斯兰教呢？
历史上的新疆，佛教、祆教、摩尼教、景教等宗教交融共存，喀喇汗王朝接受伊斯兰教以后，于10世纪中叶向信仰佛教的于阗王国发动了40余年的宗教战争，强制推行伊斯兰教。14世纪中叶，东察合台汗国统治者以战争等强制手段，强迫库车、沙雅、温宿等地民众信仰伊斯兰教。16世纪初，新疆形成了以伊斯兰教为主的多种宗教并存格局，并延续至今。所以维吾尔族信仰伊斯兰教，不是当时民众主动改信，而是宗教战争和统治阶级强制推行的结果。
（明代的铜鎏金金刚萨埵像）
阿克苏境内有一种独特的多浪文化（又称“刀郎”），以歌颂爱情和自由、赞美自然的乐舞和绘画为主要表现形式，感染力强，影响度广，前些年有个叫“刀郎”的歌手，艺名就是来自这种文化。
“刀郎”是聚集的意思，诞生于上文提到的察合台汗国统治时期，那时许多小国互相征战，民不聊生，为了躲避战乱，人们纷纷外逃。一些蒙古贵族掠夺大量贫民为奴，在自己的庄园从事劳动或当兵打仗，刀郎人就产生于这些难民和奴隶。后来他们不堪忍受欺侮，逃到了叶尔羌河下游平原荒无人烟的大漠胡杨林，聚在一起过着自由自在的流浪生活。清朝初期，部分刀郎人从喀什噶尔一带迁入阿克苏境内，刀郎文化得以形成和发展。
（胡杨木独木舟和刀郎热瓦甫等乐器）
博物馆中还有一座古代钱币厅，展示了具有鲜明地域特色、又继承中原钱币形制的新疆钱币，篇幅所限，就不详细介绍了。
上文提到的姑墨古城，就位于今天的阿克苏市区。汉朝统一西域后，为保护出使外国和外国来京的使者及商贾，在沿途重要地点专门设置了“亭”以管理治安，阿克苏境内由东向西先后设置了龟兹亭、姑墨亭和温宿亭。如今仿建的姑墨亭也是阿克苏市区的一景。
