战略方面，本作使用的还是前几代的框架。游戏共有5个历史剧本（不含DLC）以及一个自设剧本，剧本里把日本划成40个地区，虽然比不上同社的信长之野望系列，但这个数字还是能让许多人满意的。玩家选择势力后要设置军师和奉行，奉行分为五类，即开发、军备、人事、交涉、计略，初期只能设置前三类，后两样功能会随着居城的建设而逐渐开放。
军师和奉行的设置会影响玩家的各项收入，游戏里以一个季度为1回合，一年是4回合，每个季度会提升玩家的金钱、士兵、名声、计略值、武将忠诚，秋季会获得粮草。收入的多寡由玩家手上城市的开发度以及奉行的能力值所决定，游戏里每个武将有采配（可以理解成指挥或者统率）、智谋、政治三项能力值，每项最高为10格，不同类别的奉行需要不同的能力值发挥作用。玩过三国志或者信野系列的玩家应该对这项设定感到十分亲切，尤其值得称赞的是本作绝大部分武将的能力值和信野系列都十分接近，而非采用他们在无双系列当中的人设，这无疑大大强化本作的历史感。
每回合玩家要使用命令书下达指令，命令书的数量由名声值决定，初期一回合只能下达一次，最高能达到五次。
下达方式分为三种：
一是采纳奉行的提案或者军师的建议；
二是玩家自行选择政策；
三是全权委托给军师。
奉行所提出的提案只能是自己所负责的方向，例如负责人事的奉行会提议招揽人才训练武将而不会提出开发农田，提案的优势在于一次行动可以发动两项政策。但由于提案的产生完全随机，所以很可能玩家很多回合都不能刷到自己想要政策，这时可以自行选择相应政策发动，但是一次只能发动一项。而委托军师则完全随机，无法预知结果，并且也是一次只能发动一项，这是最不推荐的选项，只有完全不懂策略游戏的玩家才会去选。
本作的提案系统是由前几作进化而来，353帝国里只能选择随机的提案政策，策略性极低。354增加了政策卡的设定，而且玩家可以随意选择政策卡，在弱化了提案系统的同时，部分强力政策的组合使得游戏的难度被大幅降低，而且武将本身也显得可有可无。本作限定了只能由奉行提出相关提案，而不是之前那样几十上百个人天马行空地随机出方案。提案分为通用政策和特殊政策，前者强度较低，每个人都可以提，玩家也能自行选择发动，后者是由特定武将自带，强度较高，只能通过该武将的提案来发动，玩家无法自行选择。
经过改动后的提案系统无疑比前几作要强上许多，由奉行提出特殊政策的设定再搭配能力值的作用也终于突出了武将的重要性，而这正是光荣出品的策略游戏所一直提倡的，不像2代帝国里玩家随便从山沟里拉出个草台班子，然后靠着几张逆天的政策卡就能发挥出顶级的效果。
帝国系列一直存在着一个顽疾，那便是对于无双脸和大众脸的处理问题。过于强化无双脸会使得战略部分显得失真，虽然无双系列的武将越来越多，但仍然只是总体里的一小部分，还有许多强力人物没有转正，例如细川藤孝不可能在内政方面弱于福岛正则，而如果前者强于后者，又成了堂堂无双脸居然弱于区区大众脸。本作登场武将有949人，不可谓不多，但制作人用巧妙的方式解决了这个问题。
这个方式就是官方使用自创武将部件自行捏人，把一些地位特殊的大众脸捏成独特造型。这个做法听着有些搞笑，但实际效果还真不错，当看见斋藤道三和大友宗麟跟信野里一样顶着个光头形象出场时，估计玩家感到亲切的同时也会忍不住称赞道——捏得还挺像。而且官方还捏了一大堆妹子出来，这些妹子都是历史上真实存在的人物，例如选1553年剧本的毛利家时，开场八个角色分别毛利元就与三个儿子以及他们四个的老婆，还真是一家老小其乐融融。
战略部分所发动的政策包括搞发展、搞破坏、招人才、训练人才、阵形、战场策、外交等等。被采纳提案的武将会获得功勋值（打仗也能获得），积累功勋值后可以提升身份，从低到高分为足轻头、侍大将、部将、家老、宿老五个等级，让人不由得联想到太阁立志传，而且和太阁立志传一样，身份会决定武将的最大带兵数。
虽然本作的策略部分显得有鼻子有眼，好像该有的都有了，但实际玩起来却会觉得非常简陋。本作的所有策略内容都是同类游戏的简化版，一年四回合，每回合最多行动五次的设定就决定了这只是个小品级游戏，其复杂程度不会超过网页游戏甚至是手游。更糟糕的地方在于本作极度缺乏以往暗荣战略游戏里所擅长营造的代入感，除开历史事件稀少，游戏里的行为逻辑也更像是无双系列的变种，玩家和武将之间君臣关系不够明显，倒像是雇主和员工，玩家随时盘算的是把不好用的武将开掉，然后去招几个能*新人。
大概是为了修补这些短板问题，本作强化了人际关系系统，并增加了通用事件数量。人际关系包括亲友、忠臣、师徒、宿敌、夫妻、好对手等，集齐四个忠臣还可以册封四天王。这个设定还是挺有意思的，而且部分事件限定了特殊关系才能触发，能给玩家带来不少欢乐，尤其是自创剧本里会取消所有武将的夫妻关系，估计很多人听到这里已经开始计划干坏事了。但是和其他系统一样，本作在这方面还是做得不够深入，偶尔触发点事件和特殊对话，只能拿来当做点缀，如果奔着这些内容开一把游戏，很快就会觉得无聊。而且本作因为取消了能力继承机制，每开一把游戏又会把数据清零，搞得玩家没有办法通过同时养成一大批武将来获得快感，只能把重心放在游戏本身。
而之所以战略部分会搞得比较简略，也是由游戏的定位所导致。战略游戏是小众类别，这方面如果做得过于硬核，就足以刷掉大部分的对象玩家了，无双和战略相结合就意味着要把受众群体刷两遍。结果搞得暗荣在两方面都不敢做得太过深入，结果反而导致游戏本身浅尝辄止，缺乏核心竞争力。
