《大鱼海棠》的故事背景是一个充满东方神话色彩的世界，生活其中的“人们”掌管着世间自然的规律，他们既不是人也不是神，他们被称作“其他人”，我们可以从电影中看到许多古籍怪志《山海经》中的生物，例如帝江，也有中国古代神话中的人物，例如祝融、赤松子等，这些人物的存在为本就诡丽的世界增添了更多的神秘与仙逸。
而《大鱼》里的女主角，是一位16岁的少女，名叫“椿”，掌管着海棠花生长的规律。故事要从椿成年后去人间观察他们所掌管的人类世界的自然规律开始说起，历练前期都很顺利，椿沿着人间的江河湖海一路赏尽喧闹繁华的红尘，她很喜爱这个充满烟火味的地方，但是天有不测风云，在她归期那天，突如其来的风暴阻挡了她的脚步，人类少年鲲为了帮助她被无情的大海吞噬了生命，椿十分自责，因此决定报答鲲的救命之恩，复活他。
在她回到家后一直惴惴不安，某天她爬上山顶吹响了属于鲲的海豚埙时身旁的神兽石像突然开口，让她在子时来到山顶摇响那枚核桃样的物什，这样会有人来接她，带她去想去的地方，椿依言照做，被带到灵婆掌管人类死去灵魂的如升楼，椿用自己一半的寿命换回了鲲的灵魂，她的命运也由此发生了改变。
另一边，青梅竹马一直暗恋椿的少年湫亲眼目睹了全过程，他暗地里也去了一趟如升楼，用自己所有的寿命与灵婆做交易换回了椿的一半寿命，看到这里很多人都唏嘘不已，觉得湫是一个痴情人，很值得心疼，后期湫因为感情之事还曾找过鹿神讨酒喝，企图一醉方休。
“你以为你接受的是谁的爱，你接受的是一个天神的爱，他将背叛所有的神灵去爱你，为你忍受一切痛苦，以此来带给你快乐。”这句酒后吐露的心底话令很多观众不禁同情怜惜他爱而不得的遭遇，但也是很多观众吐槽的热点。这句话中的“天神“极大可能是指湫自己，而自诩为天神一般的存在，多少会显得这个少年有些夸张中二，感觉就像一个喝醉酒的少年借机发酒疯以抒发追不到妹子的苦恼。
而女主角椿也毫无意外地得到了众多观众的大波吐槽。从她决定复活鲲开始到之后的一系列行为，都能看出这个妹子是个坚持不懈的好女孩，但是因为一己私欲给自己的世界带来那么多灾难还不知停手就显得有些无脑，尤其是后期发给男二的那张“哥哥卡“，在观众中引起轩然大波，很多人都觉得，这样的大好青年都要放过当真是没救了。而最后湫为了她甘愿牺牲更是令许多观众心碎了一地，纷纷叫嚷还我湫小天使，既然你不喜欢他那就放着我来云云，当真是生活不易，椿椿叹气啊。
