数码宝贝中存在着各种势力，而当中最早出现的就是初代当中的黑暗四天王和启示录兽，不过由于出现得早虽然作为最后的Boss但实力与后期出现的数码宝贝还是有一定的差距。
当中实力最强绝对是皇家骑士和世界树，而当中的阿尔法兽和奥米茄兽更是最强，虽然皇家骑士同样是从属于世界树但他们的行动都只是遵循各自的正义，因此经常出现皇家骑士对立的情况。
即使这样作为整个网络安全的最终守护神，十三位皇家骑士依然是站在整个数码世界顶端的组织，而背后的世界树虽然甚少被提及，但绝对是皇家骑士里的核心，一直暗中掌控着数码世界。
七魔王是仅弱于皇家骑士的组织，六只究极体再加上光明兽这个完全体，分别代表着七宗罪的魔王型数码宝贝，这七只数码宝贝的强大毋庸置疑，有着不弱于皇家骑士的实力而他们的立场基本一直。
因为各自掌管不同的罪责，不会发生立场不相同的情况，基本不会有对立的情况出现，虽然甚少会发生同时行动的情况，一旦出动必然会引起数码世界的腥风血雨。
作为曾经拯救了古代数码世界的十斗士其传说一直被记录下来，经过漫长的岁月这10只究极体的数码宝贝分别分理出人型斗魂和兽型斗魂存在，当两种斗魂再汇聚在一起时古代斗魂就会苏醒。
而当数码世界再次陷入危机之时，所有斗魂就将汇合在一起成为金刚武神兽，金刚武神兽是掌管破坏与再生的数码宝贝，能够将整个数码网络通过破坏再重新构筑，实力完全就不是一般数码宝贝可以比拟。
黑暗四天王可以说最熟悉的数码宝贝，作为最早登场强大数码宝贝最初绝对就是被选中孩子的噩梦，其背后的军队更是曾经把整个数码世界搞得毫无生机。
而且即使强如四圣兽也一样败在了黑暗四天王的手下，虽然他们喜欢各自行动但团队合作才是最强形态几乎没有任何败绩。而为黑暗四天王背后的启示录兽才是真正的威胁，在火场另外一边数码宝贝，由消失数码宝贝的怨念和人类消极思考产生，假如突破火场进入数码世界后果将不堪设想。
当然数码世界的组织还不止这四个，三大天使和天使队列、四圣兽、四大龙这些都比较弱的就不多做介绍，也存在未经确认的奥林匹斯十二神的数码宝贝据说能够比肩皇家骑士，但目前真正有这样组织行动过的就是以上的四个。
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