奥美拉唑
3.消化酶类药物
人体消化系统本身包含多种酶类，如胰蛋白酶、胃蛋白酶、脂肪酶等，这些酶如果缺乏，人体的消化功能也会受到影响。
消化酶类药物实际是一种替代补充疗法，补充相应酶类以恢复正常的消化水平。现在也有不少药物是将几种酶融合在一起，即复方制剂，其中包含消化道常见的酶类，这种方法比较常见。复方消化酶可改善与进餐相关的腹胀、食欲不振等症状，其联合促胃肠动力药物的疗效优于单用促动力药物。
代表药物：多酶片、复方消化酶胶囊。
多酶片
4.保护胃黏膜类药物
对于功能性消化不良患者，需要服用胃黏膜保护剂的情况主要有两种：一是人体本身由于疾病的影响导致胃黏膜功能受到影响，胃肠道分泌物中有两种物质，即保护胃黏膜与损伤胃黏膜的物质，两者之间保持平衡，一旦受到疾病影响失去平衡，便容易出现胃溃疡，需要通过服用黏膜保护药物使黏膜分泌重新恢复平衡。
另外，人们服用某些药物也容易损伤胃黏膜， 这也是需要服用胃黏膜保护剂比较常见的情况。
黏膜保护类药物主要也有两种，胃分泌的黏液本身具有保护胃黏膜的作用，如果受到消化不良等症状的影响，胃黏膜相应减少，其中一类药物便是通过补充黏膜保护剂或刺激肠胃产生胃黏膜保护剂促使其恢复正常；另一类药物则是直接具有物理化学性质，在胃表面形成胶体类物质，起到保护作用。
代表药物：氢氧化铝、碳酸氢钠（小苏打）。
5.调节肠道菌群药物
这类药物是利用国家批准的有利于肠道菌群平衡的益生菌制成的，主要作用是恢复并保持处于紊乱状态的肠道菌群，因为肠道菌群一旦失衡，容易导致便秘、腹胀、腹泻等消化不良症状。之所以称其为益生菌，是因为这类药物并不直接帮助消化，而是通过维持肠道的菌群平衡使得肠道的消化、抗菌等功能恢复正常。
代表药物：培菲康（双歧杆菌三联活菌散）。
6.助消化中药
中药在治疗消化不良方面也有很多经验，神曲、木香、山楂、麦芽、谷芽、陈皮等都可用于治疗消化不良（水剂煎服）。
还有研究证明：山楂能增加胃中消化酶的分泌、促进消化，并含有脂肪酶，能增强胃脂肪酶、蛋白酶的活性。麦芽、谷芽适宜于食用米面类食物过多引起的消化不良，二者均含有淀粉酶，有消化淀粉的作用。
代表药物：健胃消食片、山楂。
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