雌雄穆托
军方依旧还是打算用核弹来对付泰坦巨兽。但他们并不知道泰坦巨兽大多都以辐射为食。
只有芹泽教授坚持认为，自然界的问题，应当由自然界去解决。而哥斯拉，就是解决问题的钥匙。
不出芹泽教授所料，哥斯拉挺身而出，以一敌二，在旧金山大战穆托夫妇，并成功击败了这对鸳鸯巨兽。
令人可喜的是，哥斯拉只为维持平衡秩序而来，大战过后，他重新回归到了大海之中。
哥斯拉回到大海
5年后，人们召开了一场“应如何与泰坦相处”的听证会。
芹泽教授提出了自己的立场，人类应当学会与泰坦共存，成为泰坦的“宠物”。
另一边，有人放出了泰坦巨兽魔斯拉，又打算放出零号怪兽基多拉。
芹泽想到的策略依然是：让哥斯拉来制衡这个世界。
哥斯拉也正有此意，开始往北极的方向进发，那里正是三头巨龙基多拉的所在地。
两头超级巨兽相遇，第一次只能说是草草了事，基多拉利用会飞的技能，脱离了战场。
第二次相遇，是在太平洋上，哥斯拉咬下了基多拉的一个头颅，形势一片大好。
