《瑶山大剿匪》这部电视剧以历史背景为依托,叙述了1950年初新中国成立后,解放军对大瑶山地区的土匪进行剿灭行动的故事。在这场行动中,主要角色是曾经被判死刑的前四野军官洪风(由丁海峰扮演),他作为飞狐小分队的队长,率领着一批各具特长、性格迥异的队员深入敌方核心地带,展开了一系列惊心动魄的斗争。
该剧的一个关键情节是飞狐小分队在深入大瑶山后,偶遇由洪风曾经的爱人邱雨(由温峥嵘扮演)领导的毒刺小分队。邱雨,这位曾与洪风有过深刻感情的女特务,因政治立场的差异与洪风分道扬镳。她领导的毒刺小分队的目标是阻挠飞狐小分队的任务。在激烈的山林对峙中,洪风和邱雨的复杂情感再次被点燃,他们在爱与恨的纠葛中面临重重抉择。