被吸收入道教后。道教继承了汉代民间的观念，认为东王公主管一切登仙得道的男子，掌管仙籍。同时为他添加“扶桑大帝”的道号，认为他有太阳神的属性。
学道之人升天时，要先拜木公后谒金母，才入三清拜太上老君、元始天尊、灵宝道君，最后面见天帝。因为王公、王母有接引成仙者的神性，东晋上清派又将东王公与西王母奉为传经的大神。
东海之内的方诸山，有诸司命三十五所，以隶天上人间罪福，东王公为大司命。在道教里，东王公与王母共理二气，是育养天地陶钧万物的两仪神。
东王公在碧海之上化生，有海神的属性。同时道教中的三官大帝，有的版本认为水官是扶桑大帝东王公，主管一切水中诸大神。
