剧本绝对是好剧本，但剧情节奏的“慢速”却在当时很不讨喜。
上起万历皇帝看似佛系实则心机的操作，中接内阁与严嵩阵营的勾心斗角，下至地方官员毁堤淹田、百姓受灾，三条线的剧情不断切换铺陈，剧集始终没有真正意义上的“爽点”，这也实打实的影响了部分收视。
第二，它拍得太深刻了，以至于观众没耐心；
另一方面，《大明王朝1566》本身确实存在观剧门槛。
没点耐心的观众，根本看不完这部剧。
贯穿全剧，充斥着一个个角色高深晦涩的台词表态。
结合角色人设和时代背景，这些看似深奥的台词在细品下后劲不小，会让人产生关于官场、人性等方面的深刻感悟。
简言之，这部看一遍未必能看懂的《大明王朝1566》确实很容易被部分观众草草放弃。
第三，它的播出时间“不友好”；
本身作品娱乐性就不高，再加上首播平台的时间安排，最终造成“国剧史最大收视惨案”的诞生。
