西安事变结束后，杨立仁和楚材还参与双方谈判事情，以及对日本的作战研究。淞沪会战时候负责对日本特务侦察，情报侦察；同时立仁还去了日本海军俱乐部。老董还让立仁给他参谋一下，防卫路线，不知道杨立仁是南京参谋部还是中统上海站，不过剧中这两个都出现过。可是根据与老董的对话，感觉杨立仁还是以做参谋为主的。
在重庆大轰炸的时刻，在防空洞里面杨立仁与林娥相遇了，杨立仁从上海被调到重庆任防空司令部的情报主任。共产国际解散的时候，杨立仁是情治部门的，并且楚材还是立仁的上级。在杨立青和林娥结婚的时候，杨立仁是重庆情报中心主任，并且是最好的情报高手。
抗战胜利的时候，杨立仁依然是搞情报的。不过很快冲突就要发生了，杨立仁也与杨立华发生争吵。随后就是解放战争发生，杨立仁已经被任命为东北保安司令部中将副参谋长，负责东北保安情报工作。剧中还提到杨立仁和杜聿明是老朋友，杜聿明非让立仁去的，立仁不方便推辞，只好做杜聿明的副参谋长。
后来杨立仁是东北最高军事长官卫立煌的部下，此时还是参谋长。最后他们被打败，汤沐雨被活捉，杨立仁逃回了南京。被楚材保了下来。
