在植物病害中，高等真菌包括锈菌、白粉菌、黑粉菌等，它们具有复杂的生命周期和多个孢子形态。
低等真菌包括霉菌、酵母菌等，它们通常以单细胞或简单的菌丝形态存在。高等真菌对植物病害的危害较大，常引起严重的病害，而低等真菌通常引起较轻微的病害。了解真菌的分类有助于更好地识别和控制植物病害。
霜霉属是高等植物病害的专性寄生菌，危害蔬菜和油料作物。常见的为寄生霜霉。根霉属会引起甘薯软腐病。赤霉菌属中的大多数为危害农作物的寄生菌。冬孢菌纲可分为黑粉菌目和锈菌目。可寄生在多种植物上，引起植物病变，例如玉蜀黍黑粉菌、小麦散黑粉菌、禾柄锈菌。另外，还有半知菌亚门中的一部分种类也是农作物和森林病害的病原菌。
