高士奇画像
值得注意的是，按照清史记载，康熙三十九年张廷玉（1700年）入值南书房。而其父亲张英【1699年，康熙将张英提拔至相位，任命其为文华殿大学士兼礼部尚书，1701年（康熙四十年）十月，张英以衰病再次乞休致，被允准以原官致仕】。也就是说张氏父子顺序在南书房配侍康熙。可见康熙对张家的信任。
按照《清史稿》记载，康熙设立南书房，以便随时都有可能召见张英和高士奇，如果二人住在宫外，怕有急事来不及。干脆让内务府在皇城的西安门内给张英和高士奇安排府邸。特别是《清史稿·高士奇传》中“词臣赐居禁城自此始”这一句，更说明了，在此之前，没有相关大臣住在紫禁城内的先例，张英和高士奇是破天荒头一遭，足见南书房二人对康熙的重要性。
综上所述，康熙成立南书房，并让张英和高士奇进入南书房，表面上是为了帮助自己学习诗文和汉文化，实际上康熙是出于政治角度考虑，一方面是成立自己的秘书智囊集团，另一方面是削弱议政王大臣会议，加强君主集权。
康熙设立南书房后，南书房取代了通政司、中书科等机构的部分职能，成为康熙最为倚重的机要秘书机构。
清朝文学家赵翼曾在《簷曝杂记》中评论南书房的重要性说：“凡撰述谕旨，多属南书房诸臣。”
也就是说，康熙的圣旨和诏令，绝大部分都是南书房大臣写出来的。这就说明他们能够得到康熙的信任，能够准确地表达康熙的想法。特别是南书房成立之初，当时正值三藩之乱，军政繁忙，张英一直陪伴康熙身边，《清史稿》记载了张英参与国策制定的一句话说“一时制造多出其手”。有时候事出紧急，康熙只要把自己的意思大致说出来，张英和高士奇两人就要迅速的写成官方的诏令或圣旨，让康熙的工作效率大大提高。
下图是南书房的内景：
南书房的内景
南书房大臣不仅要才思敏捷，迅速领会康熙的意图，还要帮康熙参谋，“以备顾问”。因此“南书房行走”，按照现在的说法就是“顾问”。
可以说，自从南书房成立后，康熙有了自己的私人秘书机构，不管对康熙本人，还是对整个朝局，都有很大的影响。
我们再看上书房
清朝的“上书房”，是皇子们读书的地方，清道光之前，叫“尚书房”（下文我们统称上书房），道光年间奉旨改为“上书房”。
上书房建于雍正初年。按照清史记载，“上书房共五间，凡皇子年界六龄，即入书房读书，一般派满汉大学士一人或二、三人为上书房总师傅，并设汉文师傅若干人，称为“谙达”的满蒙师傅若干人，均多以贵臣充任”。
上书房篆刻
上书房位于乾清门内东侧南庑。因此，从雍正年间开始，南书房和上书房同时存在。下图是两个机构的位置，在今天的故宫这两个地方都存在，南书房还能看到当初的样子，不过，上书房已经变成了一个展览厅（兼卖故宫纪念品）。
名曰陪皇子读书，但是皇子中一定有将来的皇上，因此，能作为皇子的老师，这也是位极人臣，至少在当时的皇上看来必须“人品贵重”，那肯定也是深得皇上信任。而且根据记载，【皇子皇孙们对师傅极为尊重，例如嘉庆帝的师傅朱文正（朱珪）入值上书房十余年，乾隆帝崩，嘉庆帝急召他入京，至京哭临，嘉庆帝执朱珪手哭失声。命值南书房，管户部三库，加太子少保，赐宅第于紫禁城西华门外】。
而且没有所谓的“上书房大臣”，只有“上书房总师傅”或“上书房师傅”。
因此，总体来说，南书房作为清朝的重要政治机构，虽然他的职能发生过变法，但对清朝政治格局有巨大影响。而上书房才是真正的“书房”（皇子读书嘛），不过入上书房的都是是皇子的师傅，因而对清朝也影响深远。
