科摩罗位于非洲东南莫桑比克海峡北端的一群火山岛上。东、西距马达加斯加岛和莫桑比克各约500公里。全国有4个大岛（大科摩罗、昂儒昂、莫埃利、马约特。马约特岛仍由法国管辖）及诸多小岛和珊瑚礁。群岛地表多山地。大科摩罗岛最大，面积1148平方公里。地势崎岖，广布森林。大科摩罗岛上的卡尔塔拉火山口是世界最大的火山口之一，主峰海拔2361米，为群岛最高峰。另有卡尔塔拉火山和巴及尼火山，均为活火山。
全境属热带雨林气候，年平均气温23℃~28℃，分旱季和雨季。年降水量1000~3000毫米。1~4月常有飓风。
岛上无矿产资源；水力资源贫乏；富森林资源，林地面积占全国面积的15%左右。
