体积较大，安装困难
空气能热泵的外形相对较大，安装过程中还需要水泵、缓冲水箱、膨胀管等零部件，因此需要较大的安装空间。不过空气能热泵根据采暖面积的大小，有着不同的型号来对应，相应的体积也有大小之分，别墅型需要用到较大体积（顶出风）的空气能热泵主机，但安装位置较宽敞，完全不用担心安装位置的问题，而电梯公寓有着小体积（侧出风）的空气能热泵主机，安装在普通中央空调外机上也是可行的。
维护麻烦
空气能热泵受到水温和水质的双重影响。当环境温度低于零下的时候，如果热泵主机没有运行或者长时间停电，容易导致采暖管道以及热泵主机出现结冰冻坏设备和管道的情况。当系统中的水质比较差，维护不及时，系统中容易结成水垢，进而腐蚀金属部件，堵塞管道等，造成系统循环不畅、热效率低以及出现漏水等问题。当然，对于水温和水质的问题，也有相应的解决方式，当出现水温过低有结冰风险的时候，可以将系统中的水排空（长时间不用的情况下），减少管道结冰的风险；当使用区域水质较差的情况下，可以通过软水净化水质，也可以增加系统清洗保养的频率，从而提高系统的稳定性。
空气能热泵有着众多的优点，同时也有着少数的缺点，事物都存在两面性，存在即合理。何况空气能热泵凭借着节能、环保的特性成为北方“煤改电”项目的主力军，北方正在大面积的普及，而在南方使用还能避免低温环境带来的能效下降的风险，因此更容易得到市场的推广以及用户的认可。
