这个丸剂的组方并不复杂，就12味药，复杂的地方在于炮制和制丸。炮制过程中使用硝石、童便、生矾、姜汁，加工过程中使用了醋、阿胶、米饮，以为缓消之计。于老师后来在《中国中医基础医学杂志》发表了“青附金丹医理功效探微”一文，对青附金丹的制作工艺步骤和蕴含的医理解读很透彻。摘录如下：
第一步:将经过特殊泡制的青皮、香附、郁金、丹参共研细末，用醋调和制成“麻子”大小的“醋糊丸”，晒干。
▶针对“妇女癥瘕等病”气滞血瘀、痰凝湿阻的核心病机，以祛邪为主，攻伐有形之邪。
▶醋有除癥瘕积聚之功，故以醋糊为丸，取其能聚合、融和、调和上药，共同发挥药力。
第二步:将阿胶融化成水，均匀涂在制成的药丸上作为“内衣”，使其颜色光泽圆润成为“阿胶光泽小丸”。
▶阿胶之用有取其补血养血之意，……阿胶有黏合之性，晒干后吸收较慢，能减缓药物有效成分的释放吸收速度;……胶者“去久病用之，取其如饴，力大滋补胶固”“此盖兼尽药力也”之意。
第三步:将人参、当归、川芎、白术、茯苓、制半夏、陈皮、炙甘草共研细末备用。用米汤将“光泽小丸”外层的阿胶浸湿，放入制好备用的药粉中搅拌，使“光泽小丸”表层沾满药粉作为“外廓”，晒干后即制成青附金丹。
▶“外廓”，针对“妇女癥瘕等病”必耗伤气血这个关键环节，补气养血兼以健脾化痰。
▶米汤性味甘平，能健脾益胃、滋阴长力。
以上诸药经过特殊加工制作，口服后依次按照“米饮外廓”→“阿胶光泽小丸”→“醋糊丸”的顺序逐渐吸收，次第发挥作用。……“其妙在以六君、归、芎为外廓，使药入胃时不知有攻消之味，而胃气不伤，迨其渐化，则对证之药已至病所，俾病去而正不伤。”（于智敏.青附金丹医理功效探微. 中国中医基础医学杂志，2018 ，24 （4）：533-534,563.）
文章也指出“其中蕴含着鲜明的创新思维与方法，对现代中医药研究与新药开发具有启迪借鉴作用”“现代制药工业应该从中医药学中汲取智慧， 古为今用”。《肘后备急方》所载“青蒿一握,以水二升渍,绞取汁,尽服之”的启迪下，有了青蒿素这一中医药献给世界的礼物。现代中药的制药工艺，也可以向中医传统的制药法取经、改进，迈上一个新台阶。
水丸的赋形剂除水外，还可以用黄酒、醋、稀药汁、糖液、蜜水溶液等。
是最常用的赋形剂，一般用的是纯水或新沸冷开水，所谓“水泛为丸”。另外，方中某些水溶性药物、毒剧药、贵重药，可先溶解或分散在水中，再与其他药粉制丸。
酒性热，味甘、辛。可借“酒力”发挥引药上行、祛风散寒、活血通络、矫腥除臭等作用，尤适于舒筋活血类方药。常用白酒和黄酒。
醋味酸、苦，性温，具有活血散瘀、理气止痛、行水消肿、矫味矫臭及引药入肝等作用，因此适用于入肝经、活血散瘀止痛的药物制备。米醋最为常用。
药汁一些不易制成粉的中药，如富含纤维的植物药（如大腹皮、丝瓜络等）、质地坚硬的矿物药（如磁石、龙骨、自然铜等）可制成煎液药汁供泛丸用；膏胶类（如鹿角胶、阿胶等）、树脂类药物（乳香、没药等）及可溶性盐（如芒硝等）等，可溶解后用以泛丸；③竹沥、乳汁、胆汁等可加水适量稀释后使用；④鲜药，比如生姜、大蒜、藕等可榨汁用以泛丸。
